استفاده از آنزیم برشی برای افزایش کارآیی نشانگرهای IRAP
Publish place: 7th national biotechnology congress of I.R. iran
Publish Year: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 652
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI07_0036
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
Abstract:
بی نظیری و توزیع فوق العاده رتروترانسپوزون ها در ژنوم گیاهی، استفاده از آنها را به عنوان نشانگر مولکولی بسیار ایده آل می سازد. تا کنون چندین سیستم نشانگری بر اساس رتروترانسپوزون ها طراحی شده است که عبارتند از: REMAP, SSAP, RBIP,IRAP نشانگر IRAP بر این اصل استوار است که رتروترانسپوزون ها معمولا تمایل دارند که به صورت خوشه ای در داخل هم قرار بگیرند و به علت اینکه در این نشانگر تنها از نواحی LTR رتروترانسپوزون ها استفاده می شود بسته به فراوانی کپی های رتروترانسپوزون ها ممکن است قطعات تولید شده به اندازه ای بزرگ باشند که روی ژل آگارز قابل تفکیک نباشد. در این تحقیق ما استفاده از آنزیم های برشی را به عنوان مکملی برای این روش توصیه و آزمایش کردیم. به این منظور از چندین ژنوتیپ گندم استفاده شد و قطعات DNA با استفاده از نشانگرهای LTR تکثیر و روی ژل آگارز تفکیک شدند سپس قطعاتی که به حالت اسمیر ظاهر شده بودند با آنزیم برشی 6 باز برش EcoRI برش داده شدند و محصولات حاصله روی ژل پلی اکریلامید تفکیک شدند. نتایج نشان داد که استفاده از یک آنزیم برشی روی محصولات PCR نشانگر IRAP که توانایی تولید قطعات قابل تمایز و امتیازدهی را نداشتند قطعات واضح و مشخص و قابل امتیازدهی تولید کردند و این امر تائید می کند در مواردی که نشانگرهای LTR کثرت و فراوانی کمی در ژنوم دارند استفاده از آنزیم برشی می تواند به عنوان یک روش مکمل مورد استفاده قرار گیرد.
Keywords:
Authors
سمیرا صفی یار
دانشجوی کارشناسی ارشد زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه گیلان
مجتبی کردرستمی
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه گیلان
علی اعلمی
استادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه گیلان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :