بررسی بیوانفورماتیکی پروموتر ژن NPR1 ژنی کلیدی در تنظیم پاسخ دفاعی در برابر بیمارگر، در گیاهان مختلف

Publish Year: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 356

This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI07_0676

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

Abstract:

یکی از پاسخ های دفاعی گیاه به تنش های محیطی انباشتن پروتئین های مرتبط با بیماریزای pr( Pathogenesis-related Proteins) است. ژن NPR1 بیان بیش از 2000 ژن دفاعی مرتبط پاسخ به بیمارگر (PR) را افزایش می دهد. افزایش بیان NPR1 مقاومت گیاهان تراژن را به بیمارگر ها افزایش داده و سطح بیان ژن های PR را افزایش می دهد. هدف از این تحقیق مقایسه پروموتر NPR1 در گیاهان مختلف است تا امکان معرفی آن به عنوان پروموتری القاپذیر اختصاصی در مقابل بیمارگر ها مورد بررسی قرار گیرد. بدین منظور با استفاده از بانک بیوانفورماتیکی 2000PHYTOZOME نوکلئوتید بالادست ناحیه کد کننده ژن NPR1 آرابیدوبسیس، برنج، ذرت، سورگوم و Citrus clementina به عنوان پروموتر انتخاب شد. سپس توسط نرم افزار PLANTCARE مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که پروموتر NPR1 در این گیاهان دارای عناصر اختصاصی پاسخ به هورمون های سالیسیلیک اسید، جاسمونیک اسید، آبسیزیک اسید و دیگر عناصر پاسخ به زخم، خشکی،قارچ، جیبرلین و اکسین است. شناسایی پروموترهای القاپذیر در برابر بیمارگر های گیاهی یکی از راهکارهای کارامد در تولیدگیاهان تراژن مقاوم به بیمارگر هاست. با حضور پروموترهای القاپذیر، ژن های پاسخ دهنده به بیمارگر در زمان حمله بیمارگر پاسخ داده و بار متابولیکی اضافی در زمان غیاب بیمارگر تحمیل نخواهد شد. از طرفی با کاهش مصرف سموم شیمایی بسیاری از هزینه های سم پاشی و آثار مخرب زیست محیطی این سموم کاهش خواهد یافت.

Authors

علی اصغر ابلی مقدم

پژوهشکده زیست فناوری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

علی نیازی

پژوهشکده زیست فناوری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

محمد جواهری

بخش گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

مصطفی خوشحال سرمست

دانشجوی دکترای باغبانی، بخش باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Shi, Z., Maximova, SN., Liu, Y, Verica, J and MJ, ...
  • Cao, H., Li, X and X, Dong. 1998. Generation of ...
  • Feys, BJ and JE, Parker. 2000. Interplay of signaling pathways ...
  • van Loon, LC., RepMand, CMJ. 2006 Significance of inducible defense-related ...
  • Hwang, SH and DJ, Hwang. 2010. Isolation and charact erization ...
  • Blanco, F., Garreto, V., Frey, N., Dominguez, C., Pe rez-Acle ...
  • Guo L. Yanhua Yu. Xinli Xia. Weilun Yin. 2010. Id ...
  • نمایش کامل مراجع