تشخیص مولکولی جدای ههای عامل گموز پسته بر اساس فیلوژنی ژنوم ریبوزومی

گموز یکی از بیماریهای مهم خاکزاد درختان پسته در ایران میباشد که همه ساله موجب خسارت فراوان به این محصول صادراتی میگردد. از این رو تشخیص صحیح عامل بیماری برای تعیین پتانسیل بیمارگر پیش از شیوع گسترده بیماری الزامینام برد. Phytophthora pistaciae میباشد که از آن جمله میتوان از Phytophthora است. عامل ایجاد گموز گونه های یک گونه ی فیلوژنتیکی محسوب م یشود، بنابراین P. pistaciae این گونه نخستین بار از ایران گزارش شده و از آنجایی کهشناسایی آن به جز با روش های مولکولی و مخصوصاً فیلوژنی مبتنی بر توال ی های دی ان ای امکان پذیر نیست. در این تحقیق پس از جداسازی جدایه ها و اثبات بیماریزایی آ نها روی درختان پسته پنج ماهه، اقدام به تشخیص مولکولی آن ها شد. دی ان ای نمونهها با استفاده از کیت خالصسازی دی ان ای ژنومی استخراج شده، نواحی توالیهای جداکنندهی نسخهبرداری شدهی فزونسازی گردید. قطعات ITS و 6 ITS 5 دی ان ای ریبوزومی با استفاده از آغازگرهای عمومی 4 / داخلی 1 و 2 و ژن 8 تقریباً 900 جفت بازی به دست آمده از واکنش زنجیرهای پلیمراز، خالصسازی، توالیسنجی و ویرایش شده، در بانک ژن وارد گردید. توالیهای آیتیدیا ان ای ریبوزومی به دست آمده با سایر آرایههای معتبر مستخرج از بانک ژن مقایسه گردید. برای به وجود آمدن دیدی دقیق از گسترهی تغییرات بینگونهای و مقایسهای صحیح در میان جمعیت گونهی هدف و سایر گونهها، در این مطالعه استفاده گردید. از رهیافت الحاق مجاور برای Phytophthora قطعات ژنومی (هستهای) حدود 80 گونه از P. تخمین توپوگرافی درختهای فیلوژنتیکی استفاده شد. بر اساس مطالعات فیلوژنتیکی جدایه های به دست آمده pistaciae تشخیص داده شد. این نخستین گزارش پس از توصیف این گونه ی جدید در ایران می باشد.

Keywords:

گونه ی فیلوژنتیکی , توالیهای جداکنندهی نسخهبرداری شدهی داخلی (آی , Phytophthora pistaciae دی ان ای ریبوزومی