مقایسه تنوع هاپلوتایپی برخی ژنوتیپ های سیب منطقه زاگرس مرکزی با استفاده از ژنوم کلروپلاست
Publish place: 8th national biotechnology congress of I.R. Iran & 4th National Conference on biosecurity
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 520
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0147
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
Abstract:
دی.ان.ا کلروپلاستی 11 نمونه سیب (Malus spp) برای مشخص کردن هاپلوتایپهای آنها با کاربرد روش PCR-PFLP بررسی شد. از مزایای اصلی این روش تحلیل راحت، صرفه جویی در زمان و هزینه ، تکرار پذیر بودن آن میباشد. تقریباً 5340bp از ژنوم کلروپلاست با کاربرد چهار جفت آغازگر عمومی کلروپلاست (BIB2, KIK2, CD و TF) و دو آنزیم برشی محدودگر (MseI و EcoRI) بررسی گردید و از ژل آگارز برای تفکیک باندها استفاده شد. قطعه تکثیری آغازگر CS به علت عدم داشتن جایگاه برش در این بررسی قابل بهره برداری نبود اما قطعه تکثیری توسط آغازگرهای BIB2, KIK2 حالت چند شکلی نشان داد و آغازگر TF هیچ قطعه ای را تکثیر ننمود. تمام جهشهای شناسایی شده حذف - اضافه در محدوده 40BP-10 بودند. ترکیب تمام جهشها چهار هاپلوتایپ (H3, H2, H1 و H4) را در نمونه های مورد بررسی معرفی نمود. معلوم گردید که بیشترین فراوانی هاپلوتایپ مربوط به H1 با حدود 36/4% فراوانی میباشد. سایر هاپلوتایپها دارای فراوانی تقریباً نزدیکی به هم بودند. اطلاعات تنوع دی.ان.ا کلروپلاستی میتواند میتواند برای مطالعات فیلورژنتیکی در این گیاه به کار رود و چند شکلیهای مشخص شده در نوم سیتوپلاسمی با روش PCR-PFLP می تواند به درک وراثت مادری در سیب کمک کند.
Keywords:
Authors
شاهین جهانگیرزاده خیاوی
دانشجوی سابق کارشناسی ارشد
ذبیح اله زمانی
استاد، دانشجوی کارشناسی ارشد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
محسن مردی
عضو هیئت علمی موسسه بیوتکنولوژی کشاورزی کرج
محمدرضا فتاحی مقدم
دانشیار و دانشجوی کارشناسی ارشد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :