شناسایی قطعات مرتب با آنزیم فرولیل استراز از ژنوم نخلخرما

آنزیم فرولیلاستراز (Feruloyl esterase) متعلق به گروه سینامولاستراز (Cinnamoyl esterase) است که از طریق حذف باند استری سبب آزاد سازی فرولیکاسید از پلیساکاریدهای حاوی فنولیکاسید موجود در دیوارهی سلولهای گیاهان شده و براین اساس تصور میشود که سبب تسهیل جوانه زنی بذر نخل خرما می شود. هدف از این پژوهش شناسایی، جداسازی و همسانه سازی ژن فرولیلاستراز از ژنوم نخل خرما (Phoenix dactylifera) و مقایسه ی آن با سایر توالیه ای ژنومی و پروتئینی این ژن میباشد. بدین منظور از برگ نخل خرما، DNA ژنومی استخراج گردید پس از طراحی آغازگر دجنریت با استفاده از توالی پروتئینی فرولیلاستراز در پایگاه اینترنتی و انجام واکنش PCR جهت تکثیر این ژن، محصول واکنش بر روی ژل آگارز الکتروفورز گردید. بلندترین باند با استفاده از پلاسمید PTG 19-T در باکتری E.coli سویه ی DH5α همسانه سازی گردید و توالیبایی شد. پس از شناسایی و حذف اینترون، مقایسه ی نوکلئوتیدی شباهت 80 درصدی با mRNA فرولیلاستراز یونجه ی یکساله (Medicago truncatula) و شباهت 71 درصدی با mRNA ژن لیپاز کرچک (Ricinus communis) را نشان داد. نتیجه ی مقایسه ی پروتئینی با فرولیل استراز یونجه ی یکساله، 63% و با لیپاز آرابیدوپسیس در هر دو گونه 74% شباهت داشت.

Keywords:

نخل خرما , فرولیل استراز