مطالعه بیوانفورماتیکی و شناسایی موتیف های موجود در پروموتر ژن های گیرنده های شبه کینازی در آرابیدوپسیس تالیانا
Publish place: 8th national biotechnology congress of I.R. Iran & 4th National Conference on biosecurity
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 601
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0339
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
Abstract:
بررسی و شناسایی موتیف های شناخته شده در پروموتر ژن های مهم و پیش بینی تغییر بیان این ژن ها تحت تاثیر تنش های زنده وغیرزنده با استفاده از تکنیک های رایانه ای یکی از زمینه های جذاب در بیوانفورماتیک است. با استفاده از بانک اطلاعاتی TAIR توالی 10 ژن رمز کننده گیرنده های شبه کینازی از آرابیدوپسیس تالیانا جمع آوری و با استفاده از برنامه های PlantCARE و AGRIS مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند و موتیف های موجود در آنها بررسی شدند. نتایج نشان دادند که توالی پروموتر این ژن ها شامل عناصر تنظیمی مختلفی مانند CAAT box TATA box ، ABRE box عناصر پاسخ به زخم، خشکی و غیره است که باعث القای بیان ژن های رمز کننده گیرنده های شبه کینازی در طول رشد و نمو و تحت تنش های زنده و غیرزنده می شود. نتایج این پژوهش نشان داد که گیرنده های شبه کینازی به احتمال زیاد علاوه بر موثر بودن در تحمل به تنش های شوری و خشکی، پاسخ به زخم در بسیار دیگر از فعالیت های فیزیولوژیک گیاه به طور مستقیم یا غیر مستقیم نقش دارند.
Keywords:
Authors
رقیه عالمی نژاد
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی، گروه بیوتکنولوژی و اصلاح نباتات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
حمید نجفی زرینی
استادیار دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
حمید رضا هاشمی پطرودی
دانشجوی دکترای بیوتکنولوژی کشاورزی پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :