تعیین جایگاه تاکسونومیکی شاه بلوط شمال ایران با استفاده از نشانگرهای مولکولی psbA و ناحیه ی بین ژنی trnH-psbA
Publish place: 8th national biotechnology congress of I.R. Iran & 4th National Conference on biosecurity
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 546
This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0830
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
Abstract:
در این تحقیق، شش پایه از سه رویشگاه شاه بلوط واقع در بخش غربی استان گیلان انتخاب شدند و ناحیه فاصله انداز غیر کد کننده ی trnH-psbA آنها تکثیر گردید . آنالیز تعیین توالی نشان داد، طول کل قطعه ژنی psbA برای کل گونه های مورد بررسی و شاه بلوط هیرکانی 66 جفت باز و بدون تنوع نوکلئوتیدی است اما قطعه بین ژنی trnH-psbA در پایه های مربوط به شاه بلوط هیرکانی صفر بود در حالیکه در کل پایه های مورد مطالعه ، 0.002 بود . از پنج جایگاه انحصاری ، جایگاه انحصاری اول در موقعیت 366 و 495 مربوط به گونه C.dentata جایگاه انحصاری دوم در موقعیت 401 و مربوط به dentataC. است . بررسی فاصله ژنتیکی گونه های بررسی نشان داد نمونه های مورد بررسی از جنگی هیرکانی فاقد فاصله ژنتیکی از یکدیگر بودند . همجنین بیشترین شباهت ژنتیکی بین شاه بلوط هیرکانی با شاه بلوط اروپپایی مشاهده شد . این تحقیق نشان داد، ناحیه ژنی psbA و بین زنی trnh-psbA دارای چهار هاپلوتیپ با تنوع هاپلوتیپی 0.58می باشند . درخت فیلوژنی بر اساس کل ناحیه ژنی psbA و بین ژنی trnH-psbA به روش حداکثر شباهت ( Maximum likelihood) با پشتوانه تکرار 1000، رسم گردید که شاه بلوط هیرکانی در یک کلاد مجزا با پشتوانه کمتر از -50 قرار گرفت . لذا مارکرهای trnH-psbA و psbA می توانند در تکنیک DNA بارکدینگی، به عنوان روشی آسان و سریع برای شناسایی جایگاه تاکسونومیکی شاه بلوط های شمال ایران، مورد توجه محققین قرار گیرند .
Keywords:
Authors
اباصلت حسین زاده کلاگر
گروه زیست شناسی سلولی و مولکولی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه مازندران، بابلسر ، کد پستی :۴۷۴۱۶-۹۵۴۴۷ ، ایران، رایانامه
فاطمه اکبرزاده روشن
گروه زیست شناسی سلولی و مولکولی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه مازندران، بابلسر ، کد پستی :۴۷۴۱۶-۹۵۴۴۷ ، ایران، رایانامه
حامد یوسف زاده
گروه جنگلداری، دانشکده منابع طبیعی دانشگاه تربیت مدرس ، نور
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :