سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

توالی یابی نسل بعدی (NGS) و کاربرد آن در گیاهان زراعی

Publish Year: 1394
Type: Conference paper
Language: Persian
View: 3,507

This Paper With 9 Page And PDF Format Ready To Download

Export:

Link to this Paper:

Document National Code:

BPCONF02_010

Index date: 8 May 2016

توالی یابی نسل بعدی (NGS) و کاربرد آن در گیاهان زراعی abstract

استفاده از تکنولوژی های نسل بعدی توالی یابی، امکان توالی یابی مجدد کل ژنوم گیاهان و یا کل ترنیکریپتوم نمونه را به گونه ای کارامدتر، اقتصادی ترو دقیق تر از قبل فراهم آورده است. توالی یابی RNA یا RNA-seq روشی برای دسته بندی ترنسکریپتوم است، که در آن سطوح بیان ژن های خاص، اسپلایسینگ افتراقی، و بیان آلل های خاص در رونوشت ها، به دقت برای بررسی بسیاری از مسائل بیولوژیکی، ارزیابی می گردد. این تکنولوژی ها به طور روزافزونی در شناسایی چند شکلی ها یتک نوکلئوتیدی ( SNP)، تهیه نقشه های لینکاژی، تعیین ژن های مقاومت، تعیین QTL ها، تعیین نواحی کروموزومی انتقال یافته به نتایج، توالی یابی کل ژنوم و کاربردهای دیگر مورداستفاده قرار می گیرند. در این مقاله با بررسی جنبه های متفاوت تکنولوژی های NGS به توصیفی کلی از مراحل و کاربردهای آن در کشاورزی و گیاهان زراعی می پردازیم.

توالی یابی نسل بعدی (NGS) و کاربرد آن در گیاهان زراعی Keywords:

تکنولوژی های نسل بعدی , گیاهان زراعی , RNA-seq

توالی یابی نسل بعدی (NGS) و کاربرد آن در گیاهان زراعی authors

شکوفه صدراوی

کارشناسی ارشد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

رحمت محمدی

داکترای، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

رضا معالی امیری

دانشیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Strickler SR, Bombarely A, Mueller LA (2012) designing a transcriptome ...
Novaes EDR, Drost WG, Farmerie GJ, Pappas D, Grattapaglia RR, ...
Alagna F, D Agostino N, Torchia L, Servili M, Rao ...
Barakat A, Diloreto D S, et al. (2009) Comparison of ...
Dassanayake M, Haas JS, Bohnert HJ, Cheeseman JN (2009) Shedding ...
Denoeud F, Aury J, et al (2008) Annotating genomes with ...
Wang ET, Sandberg R et al (2008). Alternative isoform regulation ...
Soltis DE, Albert VAJ, et al (2009) Polyploidy and angiosperm ...
Mamanova L, Coffey A J, et al (2010) T arget- ...
Martin JA, Wang Z (2011) Next -generation transcriptome assembly. Genetics. ...
Altschul SF, Madden TL, Schaffer AA, Zhang J, Zhang Z, ...
Collins LJ, Biggs PJ, Voelckel C, Joly S (2008) An ...
Alagna F, D Agostino N, Torchia L, Servili M, Rao ...
Brautigam A, Mullick T, Schliesky S, and Weber APM (2011) ...
Gotz SJ, Garcia-gomez M, et al (2008) H igh-throughput functional ...
Karp PD, paley SM, et al (2010) Pathway Tools version ...
Hoen PT, Ariyurek Y, Thygesen H (2008) Deep sequen cingbased ...
Varshney RK, Nayak SN, May GD, Jackson SA (2009b) Next ...
Varshney RK, et al (2009 a) Orphan legume crops enter ...
نمایش کامل مراجع

مقاله فارسی "توالی یابی نسل بعدی (NGS) و کاربرد آن در گیاهان زراعی" توسط شکوفه صدراوی، کارشناسی ارشد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران؛ رحمت محمدی، داکترای، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران؛ رضا معالی امیری، دانشیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران نوشته شده و در سال 1394 پس از تایید کمیته علمی دومین همایش علمی پژوهشی زیست شناسی و علوم باغبانی ایران پذیرفته شده است. کلمات کلیدی استفاده شده در این مقاله تکنولوژی های نسل بعدی، گیاهان زراعی، RNA-seq هستند. این مقاله در تاریخ 19 اردیبهشت 1395 توسط سیویلیکا نمایه سازی و منتشر شده است و تاکنون 3507 بار صفحه این مقاله مشاهده شده است. در چکیده این مقاله اشاره شده است که استفاده از تکنولوژی های نسل بعدی توالی یابی، امکان توالی یابی مجدد کل ژنوم گیاهان و یا کل ترنیکریپتوم نمونه را به گونه ای کارامدتر، اقتصادی ترو دقیق تر از قبل فراهم آورده است. توالی یابی RNA یا RNA-seq روشی برای دسته بندی ترنسکریپتوم است، که در آن سطوح بیان ژن های خاص، اسپلایسینگ افتراقی، و بیان آلل های خاص ... . برای دانلود فایل کامل مقاله توالی یابی نسل بعدی (NGS) و کاربرد آن در گیاهان زراعی با 9 صفحه به فرمت PDF، میتوانید از طریق بخش "دانلود فایل کامل" اقدام نمایید.