طراحی پرایمر مربوط به ژن های neuS ، kpsII ، iutA ، ibeA و cdtB به منظور شناسایی دقیق باکتری اشریشیاکلای

Publish Year: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 1,683

متن کامل این Paper منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل Paper (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

BPCONF02_020

تاریخ نمایه سازی: 19 اردیبهشت 1395

Abstract:

باکتری اشریشیاکلای به دلیل توانایی در کسب ژنها یا جزایر پاتوژنیسیته و در نتیجه ایجاد سویههای پاتوژن، یکی از مهمترین پاتوژن های انسانی به شمار می آید. از اینرو تشخیص دقیق این باکتری ضروری است. تکنیک PCR چندگانه بااقابلیت شناسایی همزمان چند توالی هدف، روشی قابل قبول در تشخیص این باکتری محسوب می شود. مهمترین مرحله در این تکنیک طراحی صحیح پرایمر می باشد. به منظور طراحی پرایمر مربوط به توالی پنج ژن neuS ، kpsII ، iutA ، ibeA و cdtB در باکتری اشریشیاکلای ، از نرم افزار MP primer استفاده گردید. سپس ویژگی های پرایمرهای طراحی شده از طریق نرم افزار Oligo Analyzer مورد بررسی قرار گرفت. در نهایت اختصاصیت پرایمرها با استفاده از نرم افزار Blast NCBI ارزیابی شد پس از بررسی اختصاصیت پرایمرها، به دلیل طراحی دقیق آنها، مشاهده شد که توالی هدف هر کدام از جفت پرایمرها، تنها در سویه های باکتری اشریشیاکلای وجود دارد. از این رو پرایمر های طراحی شده در این پژوهش، برای شناسایی این باکتری بسیار مناسب می باشد.

Authors

میلاد شکوهی نیا

کارشناسی ارشد،گروه زیست، دانشگاه ملی زابل، زابل، ایران

رویا بیت سیاح

کارشناسی ارشد،گروه زیست، دانشگاه ملی زابل، زابل، ایران

احمد راشکی

دانشیار، گروه زیست، دانشگاه ملی زابل، زابل، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • شکوهی‌نیا. م، راشکی. ا، حدادی. ف، شاه کرمی. ف. فراوانی ...
  • P. Markoulatos, N. Siafakas and M. Moncan, "Multiplex Polymerase Chain ...
  • W.Qu, Z. Shen, D. Zhao, Y. Yang, and C. Zhang. ...
  • Z. Shen, et al. "MPprimer: a program for reliable multiplex ...
  • نمایش کامل مراجع