افزایش نرخ فشرده سازی رشته ی DNA با استفاده از جستجوی کتاب رمز بهینه به کمک الگوریتم بهینه سازی ازدحام ذرات تطبیقی
Publish Year: 1394
Type: Conference paper
Language: Persian
View: 593
This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
Export:
Document National Code:
ICTCK02_116
Index date: 29 October 2016
افزایش نرخ فشرده سازی رشته ی DNA با استفاده از جستجوی کتاب رمز بهینه به کمک الگوریتم بهینه سازی ازدحام ذرات تطبیقی abstract
؛DNA یک ساختار مولکولی است که حاوی اطلاعات وراثتی می باشد. ویژگی ذاتی و مهم DNA این است که یک رشته ی DNA شامل زیررشته های تکراری بسیاری میباشد. به همین دلیل امروزه اکثر فشرده سازها به جستجو و کد کردن این زیررشته های تکراری میپردازند. در این مقاله ابتدا یک کتاب رمز با استفاده از جستجوی قالب های تکراری در داخل رشته ی DNA به کمک الگوریتم بهینه سازی ازدحام ذرات تطبیقی فازی تهیه شده، سپس فشرده سازی رشته ی DNA به کمک آن صورت میگیرد. در انتها فایل بدست آمده توسط بهترین انتخاب از بین bzip2 و هافمن مجددا کدگذاری میشود. الگوریتم فضای کمی جهت انجام عملیات فشردهسازی نیاز دارد و دارای پیچیدگی زیادی نمی باشد، بنابراین برای انجام عملیات فشردهسازی نیاز به سخت افزار قدرتمندی نداریم. ویژگی دیگر این الگوریتم ازبین بردن محدودیت های سایر روشها می باشد، یعنی وابسته به نوع روش ذخیره سازی و گروه خاصی از رشته ها نیستو هر رشته ی DNA در فرمت عمومی را به عنوان ورودی قبول میکند. همچنین در این الگوریتم برای اولین بار، بهترین مقدار برای طول زیررشته طی عملیات فشرده سازی بدست آمده و می تواند متغییر نیز باشد. الگوریتم پیشنهادی بر روی 10 رشته ی DNA محک تست شده و نشان داده است که توانسته نرخ فشرده سازی بهتری نسبت به سایر روشهای معروف فشرده سازی DNA بدست آورد.
افزایش نرخ فشرده سازی رشته ی DNA با استفاده از جستجوی کتاب رمز بهینه به کمک الگوریتم بهینه سازی ازدحام ذرات تطبیقی Keywords:
افزایش نرخ فشرده سازی رشته ی DNA با استفاده از جستجوی کتاب رمز بهینه به کمک الگوریتم بهینه سازی ازدحام ذرات تطبیقی authors
مریم رفیعا
گروه هوش مصنوعی، واحد مشهد، دانشگاه آزاد اسلامی، مشهد، ایران
مهدی یعقوبی
گروه هوش مصنوعی، واحد مشهد، دانشگاه آزاد اسلامی، مشهد، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :