بررسی بیوانفوماتیکی ژن مقاومت به سویه آسیایی باکتری عاملبیماری میوه سبز مرکبات در گیاه گریپ فروت

بیماری میوه سبز مرکبات از جمله مهمترین بیمار یهای باکتریایی مرکبات در مناطق جنوبی کشوراست. با توجه به ماهیت بیماری، استفاده از ارقام مقاوم مناسب ترین راهکار در جهت مبارزه با اینبیماری است. اخیرا، مطالعه جامع برهمکنش میزبان-پاتوژن و شناسایی ژن های دخیل در اینبرهمکنش، نشان داد که در گریپ فروت متحمل به این بیماری، بیان یک ژن آنالوگ مقاومتNucleotide Binding Site- Leucien-Rich Repeats (NBS-LRR) متعلق به خانوادهافزایش مییابد. در این تحقیق جداسازی ژن (NBS552)با آغازگرهای اختصاصی از گریپ-فروت به روش PCRصورت گرفت و در پلاسمید pGEM-T همسانه سازی شد. آنالیز توالییابینشان داد که چارچوب بازخوانی این ژن 171جفت باز است و پروتیین با طول 57اسید امینه راکد میکند. نتایج بررسی های بیوانفورماتیکی نشان داد که این ژن در بین گونه های گیاهی دارایتوالی های حفاظتی بالایی است و احتمالا ترشح پروتیین NBS552 در غشاء پلاسمایی و ترشحخارج سلولی آن ناچیز است. هدف این مطالعه جداسازی و همسانه سازی ژن NBS552از ژنومگیاه گریپ فروت و تعیین مشخصات آن به منظور استفاده کاربردی در گیاهان است

Keywords:

گریپ فروت , NBS552 , میوه سبز مرکبات , مقاومت