مطالعه برهمکنش مشتقات کویینو کسالین با فسفودی استراز 2 با استفاده از روش داکینگ مولکولی

آنزیم های PDE، هیدرولازهایی هستند که به طور انتخابی هیدرولیز نوکلیوتیدهای cAMP و cGMP را کاتالیز می کنند وتاکنون 53 ایزوآنزیم ازآن ها شناسایی شده است، این آنزیم ها دسترسی پیام رسانه های ثانویه به عامل های درون سلولی شان را کنترل می کنند.فسفودی استراز با عمل هیدرولیز کاتالیتیکی می تواندcAMP /cGMP را غیرفعال کند که این مکانیسم باعث بروز بسیاری از اختلالات عصبی و روانی مانند اسکیزوفرنی است .به همین دلیل مهارکننده PDE2Aبه عنوان رویکرد درمانی دربیماریهایی مثل اسکیزوفرنی وآلزایمر در نظر گرفته شده است. اخیرا وگنر و همکارانش دسته ای از مهارکننده های فسفودی استراز 2(PDE2A) را سنتز نموده اند و لیستی ازاین مهارکننده ها همراه با مقدار IC50 آنها ارایه داده اندکه داده های ما در این پروژه است.به کمک نرم افزار HyperChem ابتدا شکل سه بعدی مولکول ها رسم می شود. سپس ساختار مولکول را می توان به روش های مختلف بهینه کرد.هدف از انجام این پروژه پیش بینی فعالیت مهارکنندگی مشتقات کویینوکسالین بر روی PDE2A جهت پیش بینی فعالیت و همچنین شناسایی عوامل ساختاری موثر برای طراحی یک دارو با فعالیت بیشتر در درمان اسکیزوفرنی است.رسم وبهینه سازی ترکیبات با Hyperchem انجام شد ، داکینگ مولکولی توسط نرم افزار Autodock 4.2 و Autodock vina و Arguslab انجام شد ونتایج با Ligplot بررسی شد.با بررسی تعامل بین پیوندهای هیدروژنی وواندروالسی وبرهمکنش های هیدروفوب به پیش بینی فعالیت زیستی یک ترکیب فعال یا غیرفعال دست می یابیم. دراین تحقیق همه ی 21 لیگاند دردسته ی ترکیبات فعال قرار گرفت.بررسی نتایج داکینگ اطلاعات مفیدی را درمورد برهمکنش های این مهارکننده ها با آنزیم دراختیار ما قرار داد.وجود پیوندهای هیدروژنی وطول این پیوندها در پیش بینی فعالیت این لیگاندها توسط داکینگ مولکولی ارتباط معناداری را نشان داد.

Keywords:

فسفودی استراز2 , مهارکننده , داکینگ مولکولی , اسکیزوفرنی