شناسایی و تعیین توالی ژن مربوط به آنتی پورتر هیدروژن/سدیم از غشای پلاسمای گیاه Kochia scoparia L.
Publish Year: 1395
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 506
This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_GEB-5-2_005
Index date: 15 April 2018
شناسایی و تعیین توالی ژن مربوط به آنتی پورتر هیدروژن/سدیم از غشای پلاسمای گیاه Kochia scoparia L. abstract
یکی از راھکارھای گیاھان برای کاھش مقدار سدیم سیتوزولی، دفع سدیم به خارج سلول است. این دفع خارج سلولی، مانع از اثرھای سمی سدیم در فرآیندھای سلولی سیتوزول می شود. ناقل ھای سدیم/ھیدروژن غشای پلاسمایی (SOS1) یکی از بھترین پروتیین ھای درگیر در این فرآیند ھستند. در این پژوھش از گیاه دولپه و شورزی Kochia scoparia به عنوان منبع برای جداسازی ژن استفاده شد. بر ھمین اساس با استفاده از آغازگرھای طراحی شده در مناطق حفاظت شده در گیاھان دیگر، طول تقریبی 3600 نوکلیوتیدی و به تبعیت از آن توالی 1200 اسیدآمینه ای از توالی کدکننده این ژن شناسایی و تعیین توالی شد. میزان شباھت این توالی در سطح نوکلیوتیدی با حداکثر 84 درصد ھمولوژی و در سطح اسیدآمینه ای 92 درصد با استفاده از بررسی BLAST تایید شد. تجزیه و تحلیل ھای بعدی برای تعیین خصوصیات پروتیینی و ارتباط آن با پروتیین ھای دیگر با استفاده از مطالعات بیوانفورماتیک انجام شد و نتایج نشان داد که منطقه حاوی مارپیچ ھای آلفای آبگریز به عنوان قطعه گذرنده از غشای پلاسمایی است و در مقابل آن دنباله با تعداد کمتر مارپیچ ھای آلفای و خاصیت آبدوستی به عنوان قطعه داخل سلولی پروتیین می باشد. این نتایج نقش دفع سدیم توسط ناقل ھای غشای پلاسمایی را برای وجود واکنش مقاومت به شوری در گیاه کوشیا تایید نمود.
شناسایی و تعیین توالی ژن مربوط به آنتی پورتر هیدروژن/سدیم از غشای پلاسمای گیاه Kochia scoparia L. Keywords:
شناسایی و تعیین توالی ژن مربوط به آنتی پورتر هیدروژن/سدیم از غشای پلاسمای گیاه Kochia scoparia L. authors
ناهید نیکخواه
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی
لیلا فهمیده
استادیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه زابل
زیبا فولادوند
مربی پژوهشکده کشاورزی و پژوهشکده زیست فناوری کشاورزی دانشگاه زابل