شناسایی و تجزیه و تحلیلmiRNA ها و ایزومیرهای جدید و ژن های هدف آن ها در گاوهای شیری مبتلا به ورم پستان

ورم پستان یکی از بیماری های عفونی غدد پستان است که هزینه های زیادی را به صنعت گاو شیری تحمیل می کند. مکانیسم تنظیمی این بیماری پیچیده بوده و تحت کنترل ژنهای تنظیمی مختلفی قرار دارد. در مطالعه حاضر، به منظور درک بهتر عناصر تنظیمی در گیر در بیماری ورم پستان، نمونه های شیر گاوهای سالم و آلوده در طی سری زمانی صفر، 12، 2، 36 و 48 ساعت پس از آلودگی جمع آوری شد. داده های miRNA - seq از نمونه های شیر به دست آمد و با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی پیشرفته، miRNAهای جدید، ژنهای هدف آنها، عملکرد احتمالی آنها، ایزو میرها و همچنین *miRNAهای جدید شناسایی شد. نتایج منجر به شناسایی نود و دو miRNA جدید شد که تعداد بیست و شش miRNA دارای ژن همولوگ و شصت و شش miRNA فاقد ژن همولوگ در دیگر گونه ها بود. بررسی گروه های کارکردی ژنهای هدف، موید نقش miRNAهای جدید در بسیاری از مکانیسم های مقابله با التهاب و آلودگی از جمله، پاسخ به تحریکات داخلی و خارجی، مرگ سلولی و تولید ایمنوگلوبین است. همچنین علاوه بر این، صد و سی و پنج *miRNA جدید نیز شناسایی شد. در مطالعه حاضر 493 ایزومیر جدید شناسایی شد که در گونه هایی نظیر انسان و موش دارای عملکردهای مرتبط با ایمنی می باشند. براساس نتایج حاصل از تحقیق حاضر، ژنهای هدف miRNAهای جدید در مسیرهای مرتبط با بیماری ورم پستان از جمله ایمنی، مرگ سلولی و التهاب نقش دارند و این مطلب می تواند موید نقش احتمالی و تنظیمی miRNAهای جدید شناسایی شده در بروز ورم پستان باشد

شناسایی و تجزیه و تحلیلmiRNA ها و ایزومیرهای جدید و ژن های هدف آن ها در گاوهای شیری مبتلا به ورم پستان Keywords:

التهاب , ایمنی , توالی یابی نسل بعد , سیستم پستانی , miRNA - seq