خوشه‌بندی داده‌های بیان ژنی و کاربرد آن در تحلیل داده‌های سرطان پستان

Publish Year: 1385
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 1,320

This Paper With 11 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

ISC08_039

تاریخ نمایه سازی: 26 دی 1388

Abstract:

به کارگیری تکنولوژی ریزسنجش DNA (ANA Microarray) در سال‌های اخیر موجب تولید حجم انبوهای از داده‌های بیان ژنی شده است. در سال‌های اخیر تحلیل آماری این داده‌ها مورد توجه پژوهشگران قرار گرفته است. در این مقاله داده‌های بیان ژنی سرطان پستان با استفاده از روش‌های آماری (خوشه بندی سلسله مراتبی و غیر سلسله مراتبی) خوشه‌بندی گردید. در هر دو روش خوشه‌بندی، داده‌ها به دو خوشه تقسیم شدند. روش‌های مختلف خوشه‌بندی با توجه با گروه‌بندی واقعی (BRCA1, BRCA2) مورد مقایسه قرار گرفتند. ویژگی روش خوشه‌بندی سلسله مراتبی در تشخیص افراد BRCA1، 94درصد و حساسیت آن 100 درصد بدست آمد، ویژگی روش خوشه‌بندی غیر سلسله مراتبی در تشخیص افراد BRCA1، 89 درصد و حساسیت آن 100 درصد بدست آمد که نشان دهنده عملکرد خوب دو روش خوشه‌بندی است.

Authors

محسن واحدی

دانشجوی کارشناسی ارشد آمار زیستی دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی

حمید علوی مجد

عضو هیئت علمی دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی

یدالله محرابی

گروه آمار دانشگاه علامه طباطبائی

بهار نقوی

گروه آمار دانشگاه علامه طباطبائی

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Efron B, Tibshirani R, Goss V, Chu G. Microarrays and ...
  • _ Haskell C.M, Bereck J _ Carcer Treatment. 5th edition. ...
  • in Israel .Eur J Cancer Prex. 2002; 11(4): 327-331 ...
  • Welsh JB, Zarrinkar PP, Sapinoso IM, Kern SG, Behling CA, ...
  • . Clerent K, Viguerie N, [Diehn M, Alizadeh A, Barbe ...
  • Satagopan JM, Papages KS, _ _ BIO STATISTICS A statistical ...
  • Eisen MB, Browm PO. DNA arrays for analysis of gene ...
  • Amaratunga D, Cabrera J. Exploration _ Aaalysis of DNA Microarray ...
  • A3ray Data. Wiley: _ Jersey, 2004. ...
  • Chen Y, Dougherty ER, Bittner ML. Ratio-based decisions and the ...
  • Afymetrix Microarray Suite User Guide. Version 4.0. 2000; Appendix A2, ...
  • Johnson RA, Wichern DW Applied Multivariate Statistical Analysis. Prentice-Ha: New ...
  • P.H. Sneath ard R.R. Sokal. The prirciples and practice of ...
  • Hartigan J A. Clustering Algorithms. Wiley: New York, 1975. ...
  • Laura J. van t Veer, Horgyue Dai, Marc J. _ ...
  • نمایش کامل مراجع