بررسی ساختار و لایه بندی جمعیت گاومیش های اکوتیپ آذری و شمالی با نشانگرهای متراکم چند شکل تک نوکلئوتیدی با استفاده از روش های Admixture، GC، PCA و MDS

در کاربردهای ژنتیک جمعیت، اختصاص افراد به جمعیت­های مربوط به خود اهمیت دارد. با توسعه تکنولوژی تعیین ژنوتیپ در مقیاس وسیع بسیاری از نشانگرها از جمله اسنیپ ها برای این مطالعات قابل دسترس شده­اند که این اسنیپ­ها در مطالعه تنوع ژنتیکی دام­های اهلی و ساختار جمعیت سودمند هستند. هدف این تحقیق بررسی ساختار و لایه­بندی گاومیش­های مناطق مختلف دو اکوتیپ آذری و شمالی با استفاده از داده­های SNPChip 90 با روش­های معمول بررسی ساختار جمعیت بود که برای این منظور تعداد 258 گاومیش از استان­های آذربایجان شرقی، آذربایجان غربی و اردبیل مربوط به اکوتیپ آذری و از استان گیلان مربوط به اکوتیپ شمالی نمونه­گیری و تعیین ژنوتیپ شدند. نتایج حاصل از کنترل ژنومیک لایه بندی ضعیفی با =1.056λ نشان داد که حاکی از وجود اختلاط (ساختار ضعیفی) در بین دو اکوتیپ است. پلات­های حاصل از تجزیه مولفه­های اصلی و مقیاس بندی چند بعدی، تفکیک این دو اکوتیپ و استان­های مختلف دو اکوتیپ را براساس فواصل انجام داد. روش Admixture نیز نزدیکی فاصله ژنتیکی افراد استان­های مختلف دو اکوتیپ را نشان داد که البته افراد خالصی هم در این بین وجود داشتند و k=3 خطای اعتبارسنجی پایینی داشت. این روش­ها قادر به جداسازی کلی حیوانات به توده­های مربوطه بودند و نتایج این تحقیق گویای ارتباط ژنتیکی نزدیک افراد چهار استان مختلف از دو اکوتیپ آذری و شمالی بود

بررسی ساختار و لایه بندی جمعیت گاومیش های اکوتیپ آذری و شمالی با نشانگرهای متراکم چند شکل تک نوکلئوتیدی با استفاده از روش های Admixture، GC، PCA و MDS Keywords:

لایه بندی جمعیت , تراشه اسنیپ 90K , گاومیش , MDS , PCA