بررسی پایگاه های توالی آلرژن ها و تعیین پایگاه داده مناسب برای آنالیز بیوانفورماتیکی آلرژنیسیته پروتئین های نوترکیب

  براساس اعلام سازمان جهانی آلرژی؛ حدود یک سوم جمعیت جهان متاثر از آلرژی اند. مطابق با ضوابط سازمان جهانی سلامت ارزیابی آلرژنیسیته پروتئین های نوترکیب ضروری است. ارزیابی آلرژنیسیته با پیشرفت های بدست آمده در آنالیزهای بیوانفورماتیکی و تعیین ساختار سه بعدی آلرژن ها تسهیل شده است. آنالیز بیوانفورماتیکی مرحله مقدماتی در ارزیابی آلرژنیسیته پروتئین های نوترکیب است که نتایج آن در سنگینی مستندات و قضاوت آلرژنیسیته اهمیت دارد. کارایی آنالیز بیوانفورماتیکی آلرژنیسیته پروتئین های نوترکیب وابسته به ماهیت و محتوای پایگاه های اطلاعاتی مورد استفاده در تحلیل است. این تحقیق با هدف بررسی و تعیین پایگاه های داده توالی مناسب برای آنالیز بیوانفورماتیکی آلرژنیسیته پروتئین های نوترکیب انجام شد. لذا پایگاه های داده آلرژن پس از مطالعه تطبیقی در سه گروه الف- عمومی، ب- مولکولی و ج- آنالیز موتیف و اپی توپ دسته بندی شد. نتایج نشان داد این پایگاه ها در حجم داده ها، سازماندهی و قابلیت ها متفاوت هستند. به منظور دستیابی به نتایج بهتر و دقیق تر، آنالیز بیوانفورماتیکی آلرژنیسیته پروتئین های نوترکیب باید بصورت ترکیبی و بهره-مندی از گروهی از پایگاه های اطلاعاتی آلرژن ها انجام شود. بدلیل گستره داده ها و الگوریتم های مختلف درباره پیش بینی آلرژنیسیته، پایگاه توالی آلرژن ها شامل Allergome, ADFS, SDAP, FARRP و Alegpred برای آنالیز بیوانفورماتیکی آلرژنیسیته پروتئین های نوترکیب توصیه می شود. همچنین در این تحقیق ارزیابی بیوانفورماتیکی آلرژنیسیته پروتئین اسموتین انجام شد. نتایج تحقیق حاکی از آن بود که براساس آنالیزهای بیوانفورماتیکی اسموتین حساسیت زا است.

Keywords:

آلرژن , پایگاه داده پروتئینی , پروتئینهای نوترکیب