بررسی اثر متقابل ژنوتیپ و محیط با جانهی داده ژنومی شبیه سازی شده

هدف از این تحقیق ارزیابی مدل های تک صفتی و چندصفتی در سناریوهای مختلف ژنومی با در نظر گرفتن جانهی جهت برآورد صحت پیش بینی ژنومی و تشخیص وجود اثر متقابل ژنوتیپ و محیط (G XE) بود. داده های ژنومی با تعداد متفاوت جایگاههای صفات کمی (90 و 900) و سطوح مختلف عدم تعادل پیوستگی (کم و زیاد = LD) برای تراکم 50 شبیه سازی شدند. سپس به طور تصادفی 90 درصد نشانگرها حذف و در مرحله بعد این نشانگرها از طریق نرم افزار FImpute (نسخه 2 / 2) جانهی شدند. میانگین صحت جانی در سناریوهای با LD زیاد و کم به ترتیب 0 / 976 و 943/. بود. در همه سناریوهای شبیه سازی شده تفاوت جزئی بین صحت ژنومی داده های اصلی و جانی مشاهده شد. صحت ژنومی با کاهش سطح LD وراثت پذیری و همبستگی ژنتیکی بین صفات کاهش یافت.

Keywords:

صحت جانبی , صحت ژنومی , عدم تعادل پیوستگی , مدل حیوانی چندصفتی