مطالعه تنوع ژنتیکی و شناسایی نشانگرهای مولکولی مرتبط با صفات تحمل به خشکی در ارزن دم روباهی [Setaria italica (L.) P. Beauv.]

بابک ناخدا; قاسم محمدی نژاد; اکرم امینی زاده

مطالعه تنوع ژنتیکی و شناسایی نشانگرهای مولکولی مرتبط با صفات تحمل به خشکی در ارزن دم روباهی [Setaria italica (L.) P. Beauv.]

Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 11، Issue: 4

Publish Year: 1398

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 26 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/1006701

Document National Code:

JR_JOAGK-11-4_011

Index date: 6 April 2020

مطالعه تنوع ژنتیکی و شناسایی نشانگرهای مولکولی مرتبط با صفات تحمل به خشکی در ارزن دم روباهی [Setaria italica (L.) P. Beauv.] abstract

هدف: شناسایی نشانگرهای پیوسته با صفات مهم زراعی یکی از مهم ترین روشها برای تسریع انتقال صفات مطلوب به ژنوتیپهای دیگر و ردیابی آنهاست. هدف از این پژوهش، ارزیابی تنوع ژنتیکی و شناسایی نشانگرهای مولکولی اطلاعرسان مرتبط با صفات تحمل به خشکی در ژنوتیپهای ارزن دمروباهی ] [Setaria italica (L.) P. Beauv. ، با استفاده از نشانگر مولکولی AFLP بود. مواد و روشها: در این مطالعه، 21 ژنوتیپ ارزن دمروباهی در سه سال زراعی 92، 93 و 95 مورد آزمایش قرار گرفتند. شاخصهای تحمل به خشکی و همبستگی بین مقادیر آنها با عملکرد دانه و بیولوژیک محاسبه شد. به منظور شناسایی نشانگرهای مولکولی مرتبط با صفات تحمل به خشکی، از تجزیه ارتباطی با استفاده از مدل خطی مخلوط (MLM) و 12 ترکیب آغازگری AFLP استفاده شد. همچنین شاخص های نشانگری و تجزیه به مولفههای اصلی نیز با استفاده از نرمافزار GenAlEx 6.5 انجام گرفت. نتایج: ترکیبات آغازگری استفاده شده در این مطالعه در مجموع 443 باند قابل تشخیص ایجاد کردند که از این تعداد 316 (%71) باند چندشکل بودند. میانگین محتوای اطلاعات چند شکلی 24/0، میانگین شاخص شانون 38/0 و میانگین شاخص نشانگری 22/6 بدست آمد و ترکیبهای M-CTG/E-ACC، M-CAA/E-ACC وM-CTA/E-AAC موثرترین ترکیبها در بررسی تنوع ژنوتیپهای مورد مطالعه بودند. براساس نتایج تجزیه به مولفههای اصلی، دو مولفه اول 13/61 درصد از تغییرات را توجیه کردند. نتایج این مطالعه نشان داد که شاخصهایHARM ، GMP وMP بهترین شاخصها در تفکیک نمونههای متحمل به خشکی بودند و نشانگرهای M-CAA/E-AAC-14 و M-CTG/E-ACC-283 با توجه به عملکرد دانه و نشانگر M-CTT/E-ACC-264 با توجه به عملکرد بیولوژیک با این شاخصها در ارتباط بودند. نتیجهگیری: براساس نتایج این پژوهش میتوان شاخصهایHARM ، GMP وMP را بهعنوان بهترین شاخصها در تفکیک نمونههای ارزن دمروباهی متحمل به خشکی، معرفی کرد. همچنین میتوان از نشانگرهای مولکولی مرتبط با این شاخصها برای بررسی تحمل به خشکی سایر ژنوتیپها در برنامههای اصلاحی آینده استفاده نمود.

مطالعه تنوع ژنتیکی و شناسایی نشانگرهای مولکولی مرتبط با صفات تحمل به خشکی در ارزن دم روباهی [Setaria italica (L.) P. Beauv.] Keywords:

ارزن دم روباهی , تجزیه ارتباطی , شاخص های تحمل به خشکی , نشانگر AFLP

مطالعه تنوع ژنتیکی و شناسایی نشانگرهای مولکولی مرتبط با صفات تحمل به خشکی در ارزن دم روباهی [Setaria italica (L.) P. Beauv.] authors

بابک ناخدا

عضو هیات علمی و رئیس بخش تحقیقات فیزیولوژی مولکولی، پژوهشگاه بیوتکنولوژی مکشاورزی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج-بلوار

قاسم محمدی نژاد

دانشیار اصلاح نباتات، بخش اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی، دانشگاه شهید باهنر کرمان ، کرمان، ایران

اکرم امینی زاده

بخش اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید باهنر کرمان

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

حیدری راویه، صبوری عاطفه، صبوری حسین و همکاران (1393) شناسایی ...

کریم کشته رضا، صبوری حسین (1397) ارزیابی کمی و مولکولی ... [مقاله ژورنالی]

نخعی آزیتا، عباسی محمدرضا، آرزمجو الیاس، آذری علی (1393) ارزیابی ... [مقاله ژورنالی]

یاقوتی پور آنیتا، فرشادفر عزت اله، سعیدی محسن (1395) تجزیه ...

Anwar J, Subhani GM, Hussain M et al. (2011) Drought ...

Bouslama M, Schapaugh WT (1984) Stress tolerance in soybean. I: ...

Cattivelli L, Rizza F, Badeck FW et al. (2008) Drought ...

Evanno G, Regnaut S, Goudet J )2005 (Detecting the number ...

Farshadfar E, Jamshidi B, Aghaee M (2012) Biplot analysis of ...

Fernandez GCJ (1992) Effective selection criteria for assessing plant stress ...

Fernandez RJ, Reynolds JF, (2000) Potential growth and drought tolerance ...

Gavuzzi P, Rizza F, Palumbo M et al. (1997) Evaluation ...

Gebhardt C, Ballvora A, Walkemeier B et al. (2004) Assessing ...

Heydari R, Sabouri A, Sabouri H et al. (2013) Identification ...

Ji Kim E, Jin Sa K, Park KC, Kyong Lee ...

Jia G, Huang X, Zhi H et al. (2013) A haplotype map of ...

Karam D, Westra P, Nissen SJ et al. (2004) Diversidade ...

Karim Koshte R, Sabouri H (2017) Relationship between ISSR and ...

Kusaka M, Lalusin AG, Fujimura T (2005) The maintenance of ...

Lata C, Sarita JH, Prasad M, Sreenivasulu N (2011) Differential ...

Majidi M, Tavakoli V, Mirlohi A, Sabzalian MR (2011) Wild ...

Mardi M, Naghavi MR, Pirseyedi SM et al. (2011) Comparative ...

Mohammadi SA, Prasanna BM (2003) Analysis of genetic diversity in ...

Nakhaei A, Abbasi MR, Arazmjoo E, Azari MA (2014) Evaluation ...

Pritchard JK, Stephens M, Donnelly P (2000) Inference of population ...

Rao NK (2004) Plant genetic resources: Advancing conservation use through ...

Saghai Maroof MA, Biyashev Yang GP, Zhang Q, Allard RW ...

Upadhyaya HD, Ravishankar CR, Narasimhudu Y et al. (2011) Identification ...

Vitkauskaite G, Venskaityte L (2011) Differences between C3 (Hordeum vulgare ...

Vos P, Hogers R, Bleeker M et al. (1995) AFLP: ...

Yaghoutipour A, Farshadfar E, Saeidi M (2019) Association analysis for ...

Yu J, Pressoir G, Briggs WH et al. (2006) A ...

نمایش کامل مراجع