بررسی آنالیز بیوانفورماتیکی ژن های انتقالی به گیاهان در ایران (cry1Ab, cry3, cry1Ac, chitinas, glucanase, PR1) به منظور بررسی ایمنی آنها
صاحب اثر: سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
نوع محتوی: طرح پژوهشی
Language: Persian
استان موضوع گزارش: البرز
شهر موضوع گزارش: کرج
Document ID: R-1059962
Publish: 16 February 2019
دسته بندی علمی: علوم کشاورزی
View: 176
Pages: 39
Publish Year: 1389
نسخه کامل Research منتشر نشده است و در دسترس نیست.
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
Abstract:
اگر چه در انتهای سال 2010 سطح زیر کشت گیاهان تراریخته به بیش از 130 میلیون هکتار رسید، ولی یکی از نگرانی های ابراز شده ریسک های ناشی از این گونه محصولات می باشد. به منظورآنالیز ریسک ناشی از محصولات تراریخته قوانین و استاندارد های وجود دارد تا بتوان بوسیله انها ایمنی محصولات تراریخته را تضمین کرد . یکی از راهکارهایی که ارایه گردیده، ارزیابی پروتیین های بیان شده حاصل از ژن هایی که به گیاهان تراریخته وارد شده با استفاده از ابزار های بیوانفورماتیکی است. در این مطالعه پروتیین های Glucanase Cry،3 CryIAb، Cry1Ac، Chitinase، وPR1 که به منظور تولید گیاهان تراریخته در کشور استفاده شده با استفاده از پایگاه های آلرژن Allermatch ، ALLERDB ،ADFS ،FARRP و SDAP با 3 روش پنجره های 80 آمینو اسیدی و 6 یا 8 اسید آمینه پیوسته یکسان بر طبق قوانین FAO-WHO مورد بررسی شد و همچنین از روش سوم که همردیفی کامل است نیز استفاده گردید. پروتیین های که آلرژی زایی را نشان می دادند، هضم آنزیمی در شرایط In silico با استفاده از Peptide Cutter و PeptideMas روی آنها صورت گرفت. سپس توالی کامل این پروتیین ها و قطعات هضم شده دارای توالی 8 اسید آمینه ای یکسان بهم پیوسته آلرژن نیز برای بررسی پتانسیل اپی توپی با نرم افزار پیش بینی پتانسیل اپی توپی صورت گرفت. ژن های cryIII، cryIAb، cryIAc هیچ نوع تشابه معنی داری با پروتیین های آلرژن نداشتند. بررسی آلرژی زایی پروتیین PR1، کیتیناز و گلوکاناز که منشا گیاهی دارند نشان داد که در تعدادی از بانک های آلرژن احتمال آلرژی زا ی وجود دارد. بررسی پتانسیل اپی توپی در مورد پروتیین PR1 و گلوکاناز هیچ نوع پتانسیل اتصال به IgE نشان ندادند اما در مورد پروتیین کیتیناز در ناحیه SQWGWC پتانسیل اتصال به میزان کمی به IgE مشاهده شد. واژه های کلیدی: آلرژن، ایمنی زیستی، بیوانفورماتیک، پایگاه-های اطلاعاتی
Authors