تحلیل فیلوژنتیکی پروتئین HC-Pro جدایههای ایرانی ویروس موزاییک زرد لوبیا
Publish place: Biological Journal of Microorganisms، Vol: 9، Issue: 34
Publish Year: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 208
This Paper With 17 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_BJM-9-34_004
تاریخ نمایه سازی: 19 اردیبهشت 1400
Abstract:
مقدمه: ویروس موزاییک زرد لوبیا (Bean yellow mosaic virus)به جنس Potyvirus و خانواده Potyviridaeتعلقدارد و دارای پراکندگی جهانی گسترده و دامنه میزبانی وسیع است. در پژوهش حاضر، روابط فیلوژنتیکی ۸ جدایه این ویروس که در سالهای زراعی ۹۶ و ۹۷ از مناطق جغرافیایی مختلف ایران (آذربایجان شرقی، اردبیل، قزوین، زنجان، همدان، خوزستان، فارس و کرمان) از روی باقلا جدا شده بودند، در مقایسه با سایر جدایههای موجود در بانک ژن بررسی شدند. مواد و روشها: برگهای گیاهان دارای نشانههای ویروسی از مزارع باقلای نواحی مختلف ایران نمونهبرداری و به آزمایشگاه منتقل شدند. بهمنظور تشخیص نمونههای آلوده به ویروس موزاییک زرد لوبیا، ابتدا از آزمون داس الیزا و آنتیبادی اختصاصی ویروس استفاده شد؛ سپس RNA کل نمونههای آلوده استخراج و ناحیه HC-Proجدایههای انتخابی تکثیر و توالییابی شد. ارزیابی توالی، بررسی روابط فیلوژنتیکی، بررسی ساختار پروتئینی و همچنین شناسایی وقوع نوترکیبی در ناحیه HC جدایههای BYMV انتخابی با نرمافزارهای مختلف انجام شد. نتایج: در درخت فیلوژنتیکی رسمشده، جدایههای ایرانی در دو گروه مونوفیلتیک مجزا قرار گرفتند؛ بهطوریکه پنج جدایه آذربایجان شرقی، قزوین، زنجان، فارس و کرمان در کنار دو جدایه از استرالیا و ژاپن که همگی از روی باقلا جدا شده بودند، در یک گروه جای گرفتند و جدایههای اردبیل، همدان و خوزستان به همراه دو جدایه دیگر ایرانی موجود در بانک ژن، دو جدایه از هند و دو جدایه از ژاپن در گروه دیگر قرار گرفتند. بر اساس نتایج آزمون نوترکیبی، هیچکدام از جدایههای ایرانی جمعآوریشده در پژوهش حاضر، جدایه نوترکیب تشخیص داده نشدند. بحث و نتیجهگیری: درک تغییرات ژنتیکی و نوترکیبی جمعیت ویروسی پیشنیاز مهمی برای تشخیص کارآمد، مدیریت موثر و کنترل بیماری در درازمدت است. قطعا نتایج در توسعه راهکارهایی کاربرد دارند که به مقاومت در برابر BYMV منتج میشوند و چنانچه این بیماری در آینده همهگیر شود، میتوانند در راستای اتخاذ راهبردهای مدیریتی اثربخش باشند.
Keywords:
Authors
علی برادر
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ولی عصر رفسنجان، ایران
احمد حسینی
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ولی عصر رفسنجان، ایران
ثمین حسینی
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ولی عصر رفسنجان، ایران
سمیه عبدانی بابکی
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ولی عصر رفسنجان، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :