بررسی تنوع ژنتیکی گرازهای وحشی ایران بر اساس توالی های ناحیه کنترل میتوکندری
Publish place: Taxonomy and biosystematics، Vol: 10، Issue: 35
Publish Year: 1397
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 322
This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_TBJ-10-35_006
Index date: 13 May 2021
بررسی تنوع ژنتیکی گرازهای وحشی ایران بر اساس توالی های ناحیه کنترل میتوکندری abstract
مدیریت و حفاظت از حیات وحش نیازمند داشتن تصویری جامع از تنوع و تغییرپذیری ژنتیکی در ساختارهای جغرافیایی است. هدف پژوهش حاضر، بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های گراز وحشی در ایران با استفاده از یک قطعه ۵۷۲ جفت بازی از ناحیه کنترل میتوکندریایی در نظر گرفته شد. به این منظور، تعداد ۲۹ نمونه متعلق به جنوب کشور توالی یابی شد؛ همچنین ۷۵ توالی دیگر که به مناطق مختلف ایران مربوط بودند از بانک ژن استخراج شدند. بر اساس تحلیل ها، چهار کلاد جهانی متعلق به گراز وحشی شامل کلادهای شرق نزدیک ۱ (NE۱)، شرق نزدیک ۲ (NE۲)، اروپایی و آسیایی در ایران حضور دارند و کلادهای اروپایی و NE۱ به ترتیب کمترین و بیشترین پراکنش را به خود اختصاص می دهند. حضور هم جای کلادها در مناطق مختلف کشور از مهم ترین جنبه های درخور توجه است. شمال غربی کشور منطقه تماس کلادهای اروپایی و آسیایی در نظر گرفته می شود. بر اساس یافته ها، تعداد ۲۰ هاپلوتایپ در ۱۰۴ توالی از ایران شناسایی شد. تنوع هاپلوتایپی و تنوع نوکلئوتیدی در نمونه های ایران به ترتیب حدود ۸۸۲/۰ (انحراف معیار= ۰۱۴/۰) و ۰۱۴۵/۰ (انحراف معیار= ۰۰۰۴۷/۰) محاسبه شد. بر اساس تحلیل AMOVA، اختلاف ژنتیکی بین کلادها (۸۴/۸۲ درصد) بیش از اختلاف ژنتیکی داخل این کلادها بود؛ علاوه بر این، نمایه FST نیز وجود ساختار ژنتیکی معناداری را بین کلادها تایید کرد. هیچ یک از نمایه های Fu’s FS و Tajima’s D، نشانه های مشخصی از وجود گسترش جمعیت شناختی ناگهانی در کلادهای گراز وحشی متعلق به ایران را تایید نکردند.
بررسی تنوع ژنتیکی گرازهای وحشی ایران بر اساس توالی های ناحیه کنترل میتوکندری Keywords:
بررسی تنوع ژنتیکی گرازهای وحشی ایران بر اساس توالی های ناحیه کنترل میتوکندری authors
محمدرضا اشرف زاده
استادیار گروه شیلات و محیط زیست، دانشکده منابع طبیعی و علوم زمین، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :