بررسی تنوع ژنتیکی گرازهای وحشی ایران بر اساس توالی های ناحیه کنترل میتوکندری

Publish Year: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 225

This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_TBJ-10-35_006

تاریخ نمایه سازی: 23 اردیبهشت 1400

Abstract:

مدیریت و حفاظت از حیات وحش نیازمند داشتن تصویری جامع از تنوع و تغییرپذیری ژنتیکی در ساختارهای جغرافیایی است. هدف پژوهش حاضر، بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های گراز وحشی در ایران با استفاده از یک قطعه ۵۷۲ جفت بازی از ناحیه کنترل میتوکندریایی در نظر گرفته شد. به این منظور، تعداد ۲۹ نمونه متعلق به جنوب کشور توالی یابی شد؛ همچنین ۷۵ توالی دیگر که به مناطق مختلف ایران مربوط بودند از بانک ژن استخراج شدند. بر اساس تحلیل ها، چهار کلاد جهانی متعلق به گراز وحشی شامل کلادهای شرق نزدیک ۱ (NE۱)، شرق نزدیک ۲ (NE۲)، اروپایی و آسیایی در ایران حضور دارند و کلادهای اروپایی و NE۱ به ترتیب کمترین و بیشترین پراکنش را به خود اختصاص می دهند. حضور هم جای کلادها در مناطق مختلف کشور از مهم ترین جنبه های درخور توجه است. شمال غربی کشور منطقه تماس کلادهای اروپایی و آسیایی در نظر گرفته می شود. بر اساس یافته ها، تعداد ۲۰ هاپلوتایپ در ۱۰۴ توالی از ایران شناسایی شد. تنوع هاپلوتایپی و تنوع نوکلئوتیدی در نمونه های ایران به ترتیب حدود ۸۸۲/۰ (انحراف معیار= ۰۱۴/۰) و ۰۱۴۵/۰ (انحراف معیار= ۰۰۰۴۷/۰) محاسبه شد. بر اساس تحلیل AMOVA، اختلاف ژنتیکی بین کلادها (۸۴/۸۲ درصد) بیش از اختلاف ژنتیکی داخل این کلادها بود؛ علاوه بر این، نمایه FST نیز وجود ساختار ژنتیکی معناداری را بین کلادها تایید کرد. هیچ یک از نمایه های Fu’s FS و Tajima’s D، نشانه های مشخصی از وجود گسترش جمعیت شناختی ناگهانی در کلادهای گراز وحشی متعلق به ایران را تایید نکردند.

Authors

محمدرضا اشرف زاده

استادیار گروه شیلات و محیط زیست، دانشکده منابع طبیعی و علوم زمین، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • منابعAkhani, H. (۲۰۰۷) Diversity, biogeography, and photosynthetic pathways of Argusia ...
  • Alexandri, P., Triantafyllidis, A., Papakostas, S., Chatzinikos, E., Platis, P., ...
  • Alves, E., Ovilo, C., Rodriguez, M. and Silio, L. (۲۰۰۳) ...
  • Alves, P. C., Pinheiro, Í., Godinho, R., Vicente, J., Gortázar, ...
  • Ashrafzadeh, M. R. and Bordkhani, M. (۲۰۱۲) New morphometric data ...
  • Ashrafzadeh, M. R., Kaboli, M. and Naghavi, M. R. (۲۰۱۶) ...
  • Ashrafzadeh, M. R., Djan, M., Szendrei, L., Paulauskas, A., Scandura, ...
  • Ashrafzadeh, M. R., Rezaei, H. R., Khalilipour, O. and Kusza, ...
  • Avise, J. C. (۲۰۰۰) Phylogeography: the history and formation of ...
  • Bandelt, H.-J., Forster, P. and Röhl, A. (۱۹۹۹) Median-joining networks ...
  • Burg, T. M., Trites, A. W. and Smith, M. J. ...
  • Excoffier, L. and Lischer, H. E. (۲۰۱۰) Arlequin suite ver ...
  • Frankham, R. (۱۹۹۶) Relationship of genetic variation to population size ...
  • Frantz, A. C., Zachos, F. E., Kirschning, J., Cellina, S., ...
  • Fu, Y.-X. (۱۹۹۷) Statistical tests of neutrality of mutations against ...
  • Goldsworthy, S., Francis, J., Boness, D. and Fleischer, R. (۲۰۰۰) ...
  • Gongora, J., Fleming, P., Spencer, P. B. S., Mason, R., ...
  • Greenwood, P. J. (۱۹۸۰) Mating systems, philopatry and dispersal in ...
  • Hewitt, G. (۲۰۰۰) The genetic legacy of the Quaternary ice ...
  • Hoffman, J., Matson, C., Amos, W., Loughlin, T. and Bickham, ...
  • Keis, M., Remm, J., Ho, S. Y. W., Davison, J., ...
  • Khalilzadeh, P., Rezaei, H. R., Fadakar, D., Serati, M., Aliabadian, ...
  • Kopatz, A., Eiken, H. G., Aspi, J., Kojola, I., Tobiassen, ...
  • Kusza, S., Ashrafzadeh, M. R., Tóth, B. and Jávor, A. ...
  • Lacy, R. C. (۱۹۹۷) Importance of genetic variation to the ...
  • Laikre, L., Nilsson, T., Primmer, C. R., Ryman, N. and ...
  • Larson, G., Dobney, K., Albarella, U., Fang, M., Matisoo-Smith, E., ...
  • Larson, G., Albarella, U., Dobney, K., Rowley-Conwy, P., Schibler, J., ...
  • Larson, G., Liu, R., Zhao, X., Yuan, J., Fuller, D., ...
  • Librado, P. and Rozas, J. (۲۰۰۹) DnaSP v۵: a software ...
  • Luetkemeier, E. S., Sodhi, M., Schook, L. B. and Malhi, ...
  • Maselli, V., Rippa, D., Deluca, A., Larson, G., Wilkens, B., ...
  • Meijaard, E. and Moqanaki, E. M. (۲۰۱۱) Sus scrofa subspecies ...
  • Mills, L. S., Schwartz, M. K., Tallmon, D. A. and ...
  • Mouthereau, F., Lacombe, O. and Vergés, J. (۲۰۱۲) Building the ...
  • Nei, M. and Kumar, S. (۲۰۰۰) Molecular evolution and phylogenetics. ...
  • Ojeda, A. A. (۲۰۱۰) Phylogeography and genetic variation in the ...
  • Ottoni, C., Girdland Flink, L., Evin, A., Geörg, C., De ...
  • Ricklefs, R. E. and Schluter, D. (۱۹۹۳) Species diversity in ...
  • Sagheb Talebi, K., Sajedi, T. and Pourhashemi, M. (۲۰۱۳) Forests ...
  • Stewart, J. R., Lister, A. M., Barnes, I. and Dalén, ...
  • Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A. and Kumar, ...
  • Weir, B. S. and Cockerham, C. C. (۱۹۸۴) Estimating F‐statistics ...
  • Wilson, D. E. and Reeder, D. M. (۲۰۰۵) Mammal species ...
  • Xia, X. (۲۰۱۳) DAMBE۵: a comprehensive software package for data ...
  • نمایش کامل مراجع