اهمیت مسیر سیگنالینگ ErbB در شناسایی بیومارکرهای تاثیرگذار بر توسعه بیماری عروق کرونری: یک مطالعه in-silico

Publish Year: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 286

This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_NCMBJ-11-43_005

تاریخ نمایه سازی: 30 شهریور 1400

Abstract:

سابقه و هدف: عروق کرونری، عروق خونی هستند که خون را به قلب منتقل می کنند. با ایجاد پلاک در دیواره این رگ ها، عمل خون رسانی با مشکل مواجه می شود. تشخیص بیماری عروق کرونری به دلیل خطراتی که برای سلامتی شخص دارد، بسیار مهم می باشد. هدف از این مطالعه بررسی ژن­های دارای تفاوت بیان بین بیماران و افراد نرمال در مسیر سیگنالینگ ErbB، به عنوان یکی از مسیرهای مهم در ایجاد این بیماری و بررسی اهمیت آنها در شناسایی بیومارکرهای بیماری عروق کرونری است. مواد و روش­ها: ابتدا فایلهای خام حاصل از RNA-sequencing نمونه ­های بیماران عروق کرونری و افراد نرمال، به ترتیب از دیتاست های با شماره GSE۹۹۹۸۵ و GSE۱۰۰۲۰۶ بدست آمده و مراحل آنالیز نمونه­ ها انجام شد. ژنهای دارای تفاوت بیان در زبان برنامه نویسی R و با پکیج DESeq۲ جداسازی شد. سپس آنالیز عملکردی ژنها از جمله مسیرهای سیگنالینگ، فرآیندهای بیولوژیکی و ژنهای دارای تفاوت بیان در مسیر ErbB و نحوه تغییرات بیان آنها مورد بررسی قرار گرفت. یافته­ ها: نتایج نشان داد ۱۰۶۹ ژن در بین نمونه های موردنظر دارای افزایش بیان و ۸۵۱ ژن نیز کاهش بیان داشتند. بعلاوه با بررسی آنالیزهای عملکردی مشخص شد ژنهایی مانند CAMK۲D، SHC۳،ERBB۳، NRG۴، RPS۶KB۲، MAPK۱، BRAF، AREG و  CRKاز جمله ژنهایی هستند که هم در بیماران تغییرات بیانی را نشان می­ دادند و هم مسیر سیگنالینگ ErbB را تحت تاثیر قرار می­دادند. نتیجه گیری: درنهایت ، بررسی­های مولکولی دقیقتر منجر به دستیابی به ژنهای  قابل اعتماد برای شناسایی بیومارکرهای بیماری عروق کرونری خواهد شد که برای تحقیقات زیست پزشکی ، توسعه دارو و کاربردهای بالینی ضروری است.  

Authors

اکرم قلی پور

Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran

فرشاد شاکریان

Cardiogenetic Research Center, Rajaie Cardiovascular Medical and Research Center, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran

علی زاهدمهر

Head of Cardiogenetic Research Center,Rajaie Cardiovascular, Medical, and Research Center,Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran

شیوا ایرانی

Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran

سید جواد مولی

Department of Molecular Genetics, Faculty of Biological Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran

مهشید ملکوتیان

Cardiogenetic Research Center, Rajaie Cardiovascular Medical and Research Center, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Mackay J, Mensah G. The Atlas of Heart Disease and ...
  • Faxon DP, Creager MA, Smith SC, Pasternak RC, Olin JW, ...
  • Choudhury R.P, Fuster V, Fayad Z.A. Molecular, cellular and functional ...
  • Schroeder JA, Jackson LF, Lee DC, Camenisch TD. Form and ...
  • Rohrbach S, Niemann B, Silber RE, Holtz J. Neuregulin receptors ...
  • Meric-Bernstam F, Johnson AM, Dumbrava EEI, Raghav K, Balaji K, ...
  • Tse C, Gauchez AS, Jacot W, Lamy PJ. HER۲ shedding ...
  • Pernas S, Tolaney SM. HER۲-positive breast cancer: new thera peutic ...
  • Beltowski J, Jazmroz-Wisniewska A. Transactivation of ErbB receptors by leptin ...
  • Shengli L, Yuchen L, Bing Ch. exoRBase: a database of ...
  • Huang T, Yang B, Zheng J, Li G, Wahlqvist ML, ...
  • Beltowski J, Jazmroz-Wisniewska A. Transactivation of ErbB receptors by leptin ...
  • Schreier B, Gekle M, Grossmann C. Role of epidermal growth ...
  • Zhang T. The deltaCisoform ofCaMKII is activated in cardiac hypertrophy ...
  • Gwathmey J.K. Abnormal intracellular calcium handling in myocardium from patients ...
  • . Maack C. Oxygen free radical release in human failing ...
  • Zhiling L, Longjiang X, Jiang L. Down-regulation of the insulin ...
  • Jie J, Mingzhu L, Yanfang X. Circulating neuregulin ۴ levels ...
  • Nan G, Nan Z, Liqiu Y, Xufen C, Jiawang W, ...
  • Kato M, Inazu T, Kawai Y, Masamura K, Yoshida M, ...
  • Dreux A.C, Lamb D.J, Modjtahedi H, Ferns G.A. The epidermal ...
  • Prigent SA, Lemoine NR, Hughes CM, Plowman GD, Selden C, ...
  • Willer CJ, Sanna S, Jackson AU, Scuteri A, Bonnycastle LL, ...
  • Buamina M, Xiang X, Yi-Tong M, Zhen-Yan F, Yi-Ning Y, ...
  • Mackay J, Mensah G. The Atlas of Heart Disease and ...
  • Faxon DP, Creager MA, Smith SC, Pasternak RC, Olin JW, ...
  • Choudhury R.P, Fuster V, Fayad Z.A. Molecular, cellular and functional ...
  • Schroeder JA, Jackson LF, Lee DC, Camenisch TD. Form and ...
  • Rohrbach S, Niemann B, Silber RE, Holtz J. Neuregulin receptors ...
  • Meric-Bernstam F, Johnson AM, Dumbrava EEI, Raghav K, Balaji K, ...
  • Tse C, Gauchez AS, Jacot W, Lamy PJ. HER۲ shedding ...
  • Pernas S, Tolaney SM. HER۲-positive breast cancer: new thera peutic ...
  • Beltowski J, Jazmroz-Wisniewska A. Transactivation of ErbB receptors by leptin ...
  • Shengli L, Yuchen L, Bing Ch. exoRBase: a database of ...
  • Huang T, Yang B, Zheng J, Li G, Wahlqvist ML, ...
  • Beltowski J, Jazmroz-Wisniewska A. Transactivation of ErbB receptors by leptin ...
  • Schreier B, Gekle M, Grossmann C. Role of epidermal growth ...
  • Zhang T. The deltaCisoform ofCaMKII is activated in cardiac hypertrophy ...
  • Gwathmey J.K. Abnormal intracellular calcium handling in myocardium from patients ...
  • . Maack C. Oxygen free radical release in human failing ...
  • Zhiling L, Longjiang X, Jiang L. Down-regulation of the insulin ...
  • Jie J, Mingzhu L, Yanfang X. Circulating neuregulin ۴ levels ...
  • Nan G, Nan Z, Liqiu Y, Xufen C, Jiawang W, ...
  • Kato M, Inazu T, Kawai Y, Masamura K, Yoshida M, ...
  • Dreux A.C, Lamb D.J, Modjtahedi H, Ferns G.A. The epidermal ...
  • Prigent SA, Lemoine NR, Hughes CM, Plowman GD, Selden C, ...
  • Willer CJ, Sanna S, Jackson AU, Scuteri A, Bonnycastle LL, ...
  • Buamina M, Xiang X, Yi-Tong M, Zhen-Yan F, Yi-Ning Y, ...
  • نمایش کامل مراجع