کاوش ژنومیک تمایز جمعیتی در نژادهای زل و لری بختیاری
Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 2، Issue: 2
Publish Year: 1389
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 319
This Paper With 14 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_JOAGK-2-2_004
Index date: 4 October 2021
کاوش ژنومیک تمایز جمعیتی در نژادهای زل و لری بختیاری abstract
انتخاب برای افزایش فراوانی موتاسیونهای جدیدی که فقط در برخی از زیرجمعیتها سودمند هستند باعث باقی گذاشتن نشانههایی در سطح ژنوم میشود. شناسایی این مناطق ژنومی یکی از مهمترین حوزههای تحقیقاتی در ژنتیک حیوانی است، زیرا این مناطق اغلب با QTLهای مرتبط با صفات مهم اقتصادی در ارتباط هستند. در این تحقیق با هدف شناسایی مناطق ژنومی که در دو نژاد گوسفند ایرانی زل و لری-بختیاری هدف انتخابهای مختلف قرار گرفتهاند، یک کاوش ژنومیک با حدود ۰۰۰,۵۴ مارکر SNP انجام شد. بررسی تمایز جمعیتی با استفاده از روش FST ویر و کوکهام نشان داد که چندین منطقه ژنومی دارای شواهدی از انتخاب در این دو نژاد هستند. در این مقاله ۵ ناحیه ژنومی که در صدک ۹۹/۹۹ کل ارزشهای FST قرار گرفته بودند برای بررسیهای بیشتر انتخاب شدند. این مناطق بر روی کروموزومهای ۲، ۵، ۷ (دو ناحیه) و X واقع شدهاند. برای ارزیابی نشانههای انتخاب بر پایه روشهای عدم تعادل لینکاژی از آزمون هموزیگوسیتی هاپلوئیدی بسطداده شده استفاده شد. نتایج این آزمون به همراه بررسی دیاگرامهای شاخهبندی هاپلوتیپی در این دو نژاد وجود تفرق جمعیتی شدید در این مناطق ژنومی را تایید کرد. در نهایت بررسی QTLهای گزارش شده در مناطق اورتولوگوس گاوی نشان داد که این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با لاشه و تولید مثل همپوشانی دارند. این تحقیق که جزء اولین مراحل توسعه نقشه انتخاب در ژنوم گوسفند محسوب می شود میتواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در راستای شناسایی ژنهای متمایز کننده این دو نژاد فراهم آورد.
کاوش ژنومیک تمایز جمعیتی در نژادهای زل و لری بختیاری Keywords:
کاوش ژنومیک تمایز جمعیتی در نژادهای زل و لری بختیاری authors
محمدحسین مرادی
دانشجوی دکتری پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران کرج
اردشیر نجاتی جوارمی
دانشیار پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران کرج
محمد مرادی شهربابک
استاد پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران کرج
کن دادز
محققین ارشد بخش ژنومیکس و تولیدمثل مرکز AgResearch نیوزیلند
جان مک ایوان
محققین ارشد بخش ژنومیکس و تولیدمثل مرکز AgResearch نیوزیلند
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :