بررسی تنوع ژنتیکی ارقام برنج ایرانی با استفاده از نشانگرهای ISSR، IRAP و REMAP

Publish Year: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 108

This Paper With 11 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JCB-8-20_005

تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400

Abstract:

در این مطالعه، تنوع ژنتیکی ۴۰ لاین و رقم بومی و اصلاح شده برنج با استفاده از نشانگرهای ISSR، IRAP و REMAP مورد ارزیابی قرار گرفت. فرآورده تکثیر برای ۲۰ نشانگر، نوارهای واضح و چندشکلی را بین ژنوتیپ ها نشان داد که در مجموع ۳۰۹ نوار با میانگین چندشکلی ۰۳/۸۸ درصد تولید شد. میانگین تنوع ژنی، شاخص شانون و محتوای اطلاعات چندشکلی به ترتیب ۳۹/۰، ۵۷/۰ و ۳۵/۰ بود. آغازگرهای UBC۸۱۱ و UBC۸۱۳ به ترتیب بالاترین شاخص های تنوع ژنتیکی را با مقادیر ۶۵/۰ و ۶۴/۰ نشان دادند. به منظور تعیین کارایی نشانگرها در بروز چندشکلی، شاخص نشانگری (MI) و نسبت چندگانه موثر (EMR) محاسبه شد که بر این اساس نشانگرهای ترکیبی TOS۲+UBC۸۱۱ و TOS۲+UBC۸۲۶ به ترتیب با بیشترین مقدار MI و EMR از کارایی بهتری برخوردار بودند. دندروگرام با استفاده از روش UPGMA ژنوتیپ ها را به ۶ گروه تقسیم کرد که بیشتر ارقام بومی مانند هاشمی، علی کاظمی و حسن سرایی در گروه دوم و ارقام اصلاح شده همچون خزر، کادوس و گوهر بیشتر در گروه سوم قرار گرفتند. همچنین نتایج نشان داد نشانگرهای مبتنی بر رتروترانسپوزون همچون REMAP از توانایی خوبی جهت نشان دادن تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم برنج برخوردارند و می توانند برای مطالعات ژنتیکی و اصلاحی برنج مورد استفاده قرار گیرند.

Authors

علی اعلمی

University of Guilan

نوش آفرین کرمی

University of Guilan

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Ajibade, S.R., N.F. Weeden and S. Michite. ۲۰۰۰. Inter simple ...
  • Anonymous. ۲۰۰۷. The SPSS system for Windows. Release ۱۶.۰.SPSS Inc., ...
  • Bennetzen, J.L. ۲۰۰۰. Transposable element contributions to plant gene and ...
  • Botstein, D., R.L. White, M. Skolnick and R.W. Davis. ۱۹۸۰. ...
  • Branco, C.J.S., E.A. Vieira, G. Malone, M.M. Kopp, E. Malone, ...
  • Casacuberta, J.M. and N. Santiago. ۲۰۰۳. Plant LTR-retrotransposons and MITEs: ...
  • Chadha, S. and T. Gopalakrishna. ۲۰۰۷. Comparative assessment of REMAP ...
  • Dash, S.K., J. Sigh, M. Tripathy and D. Mishra. ۱۹۹۶. ...
  • Derierwala, A.P., W. Ramakrishna, P.H. Ranjekar and V.S. Gupta. ۲۰۰۰. ...
  • Galvan, M.Z., B. Bornet, P.A. Balatti and M. Branchard. ۲۰۰۳. ...
  • Gao, L., E.M. McCarthy and E.W. Ganko. ۲۰۰۴. Evolutionary history ...
  • ۱۲.Hair, J.R., R.E. Anderson, R.L. Tatham and W.C. Black. ۱۹۹۵. ...
  • Hassani Tesie, S.F., H. Samizadeh Lahiji and M. Shoaei Deilami. ...
  • Herrera, T.C.H., D.P. Duque, I.P. Almeida, G.T. Nunez, A.J. Pieters, ...
  • Kalender, R., T. Grob, M. Regina, A. Souniemi and A.H. ...
  • Kalendar, R., A.J. Flavell, T.H.N. Ellis, T. Sjakste, C. Moisy ...
  • Kashkush, K. ۲۰۰۷. Genome-wide impact of transcriptional activation of long ...
  • Kaye, C., J. Milazzo, S. Rozenfeld, M.H. Lebrun and D. ...
  • Lu, G., P.F. Cannon, A. Reidand and C.M. Simmons. ۲۰۰۴. ...
  • Mahjoob, B., H. Najafi-Zarini and S.H.R. Hashemi. ۲۰۱۴. Assessment of ...
  • Mathure, S., N. Jawali and A. Nadaf. ۲۰۱۰. Diversity Analysis ...
  • McCarthy, E.M., J. Liu, L.Z. Gao. ۲۰۰۲. Long terminal repeat ...
  • Mir Derikvand, M., Gh. Nematzadeh, A. Aalamiand B. Ghareyazie. ۲۰۰۴. ...
  • Mohsenzadeh Golfzane, M., H. Samizadeh, A. Aalami, M. Shoaei Daylami ...
  • Murray, M. and W.F. Thampson. ۱۹۸۰. Rapid isolation of high ...
  • Nagaoka, T. and Y. Ogihara. ۱۹۹۷. Applicability of inter simple ...
  • Nagaraju, J., M. Kathirvel, R. Ramesh Kumar, E.A. Siddiq and ...
  • Nei, M. ۱۹۷۳. Analysis of gene diversity in subdivided populations, ...
  • Pandotra, P., M.K. Husain, G. Ram, S. Gupta and A.P. ...
  • Rohlf, F.J. ۱۹۹۲. NTSYS-PC: Numerical taxonomy and multivariate analysis system, ...
  • Roldan-Ruiz, I., J. Dendauw, E. Vanbockstaele, A. Depicker and M. ...
  • Saker, M.M., S.S. Yossef, N.A. Abdullah, H.S. Bashandy and A.M. ...
  • Schulman, A.H. ۲۰۰۷. Molecular markers to assessgenetic diversity. Euphytica. ۱۵۸: ...
  • Second, G. ۱۹۹۱. Molecular markers in rice systematics and the ...
  • Seehalak, W., N. Tomooka, A. Waranyuwat, P. Thipyapong, P. Laosuwan, ...
  • Sneath, PH.A. and R.R. Sokal. ۱۹۷۳. Numerical Taxonomy. Freeman, San ...
  • VSN International. ۲۰۰۹. GenStat for Windows ۱۲th Edition. VSN International, ...
  • Wu, C.J., Z.Q. Cheng, X.Q. Huan, S.H. Yin, K.M. Cao ...
  • Yang, B.C., B.G. Xiao, X.J. Chenl and C.H. Shi. ۲۰۰۷. ...
  • Ya-tao, W., A. Xin-xiang, F. Chuan-zhang, X. Fu-rong, Y. Teng-qiong, ...
  • Yeh, F.C. and R. Yang. ۱۹۹۹. Popgene Ver. ۱.۳۱ Microsoft ...
  • Zhang, C.H., J.Z. Li, Z. Zhu, Y.D. Zhang, L. Zhao ...
  • Zhu, J., M.D. Gale and S. Guarrie. ۱۹۹۸. AFLP markers ...
  • Zhu, H., Z. Xie and S. Ge. ۲۰۰۳. Microsatellite analysis ...
  • Zietkiewicz, E., A. Rafalski and D. Labuda. ۱۹۹۴. Genome fingerprinting ...
  • نمایش کامل مراجع