تجزیه ارتباط و ساختار بخشی از ذخایر ژنتیکی برنج (Oryza sativa L.) بر اساس نشانگرهای ریزماهواره

حیدر عزیزی; علی اعلمی; مسعود اصفهانی; علی اکبر عبادی

تجزیه ارتباط و ساختار بخشی از ذخایر ژنتیکی برنج (Oryza sativa L.) بر اساس نشانگرهای ریزماهواره

Publish place: Cereal Research، Vol: 7، Issue: 1

Publish Year: 1396

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 16 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

کشاورزی > برنج

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/1296315

Document National Code:

JR_CRGU-7-1_001

Index date: 25 October 2021

تجزیه ارتباط و ساختار بخشی از ذخایر ژنتیکی برنج (Oryza sativa L.) بر اساس نشانگرهای ریزماهواره abstract

ارزش اقتصادی یک رقم به صفات مختلف آن بستگی دارد و از اینرو اطلاع دقیق از رفتار ژنتیکی و شناسایی مکانهای ژنومی دخیل در کنترل این صفات میتواند به بهنژادگر در اصلاح ارقام کمک کند. در این تحقیق، ارتباط و پیوستگی بین ۲۵ نشانگر ریزماهواره با برخی از صفات مهم زراعی و مرفولوژیک در ۱۲۱ لاین و رقم مختلف برنج از طریق مدلهای ارتباطیابی شامل مدل خطی عمومی (GLM) و مدل خطی مخلوط (MLM) با استفاده از نرمافزارهای Structure و Tassel مورد ارزیابی قرار گرفت. بر اساس ۲۵ نشانگر ریزماهواره مورد استفاده در این مطالعه، ساختار ژنتیکی جمعیت به پنج زیرجمعیت فرعی (۵=K) تقسیم شد که نتایج حاصل از رسم بارپلات نیز آنرا تایید کرد. در تجزیه ارتباطی با دو روش GLM و MLM، بهترتیب ۲۶ و ۳۰ نشانگر، ارتباط معنیداری را با صفات مورد مطالعه نشان دادند و تغییرات قابل توجهی از این صفات را توجیه کردند. وجود نشانگرهای مشترک در میان برخی صفات بررسی شده مانند ارتباط معنیدار نشانگر RM۵ با صفات طول و عرض برگ پرچم و نشانگر RM۳۳۵۵ با صفات تعداد روز تا ۵۰ درصد گلدهی و ارتفاع بوته میتواند ناشی از آثار پلیوتروپی و یا پیوستگی نواحی ژنومی دخیل در این صفات باشد. همچنین، نشانگرهای RM۱۹۰ و RM۶۰۸۰ با ضریب تبیین بالابهترتیب با صفات طول شلتوک و عملکرد دانه منتسب شدند که میتوانند پس از آزمایشهای تکمیلی و تایید نتایج، بهمنظور شناسایی ژنهای رمزکننده این صفات، ناحیه ژنومی مربوطه اشباع و توالییابی شوند.

تجزیه ارتباط و ساختار بخشی از ذخایر ژنتیکی برنج (Oryza sativa L.) بر اساس نشانگرهای ریزماهواره Keywords:

ساختار ژنتیکی جمعیت , پلیوتروپی , عدم تعادل لینکاژی

تجزیه ارتباط و ساختار بخشی از ذخایر ژنتیکی برنج (Oryza sativa L.) بر اساس نشانگرهای ریزماهواره authors

حیدر عزیزی

دانش آموخته دکتری، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران

علی اعلمی

استادیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران

مسعود اصفهانی

استاد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران

علی اکبر عبادی

استادیار پژوهش، بخش اصلاح و تهیه بذر، موسسه تحقیقات برنج کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رشت، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

Agrama, H. A., Eizenga, G. C. and Yan, W. ۲۰۰۷. ...

Allahgholipour, M., Mohammad Salehi, M. S. and Ebadi, A. A. ...

Al-Maskri, A. H., Sajjad, M. and Khan, S. H. ۲۰۱۲. ...

Andersen, J. R., Zein, I., Wenzel, G., Krützfeldt, B., Eder, ...

Anderson, J. A., Churchill, G. A., Autrique, J. E. and ...

Breseghello, F. and Sorrells, M. E. ۲۰۰۶. Association mapping of ...

Ching, A., Caldwell, K. S., Jung, M., Dolan, M., Smith, ...

Das, B., Sengupta, S., Parida, S. K., Roy, B., Gosh, ...

DeWan, A., Liu, M., Hartman, S. and Zhang, S. S. ...

Doerge, R. W. ۲۰۰۲. Mapping and analysis of quantitative trait ...

Evanno, G., Regnaut, S. and Goudet, J. ۲۰۰۵. Detecting the ...

FAO. ۲۰۱۳. Food and agriculture organization of the United States. ...

Gupta, P. K., Rustgi, S. and Kulwal, P. L. ۲۰۰۵. ...

IRRI. ۲۰۰۲. Standard evaluation system for rice. International Rice Research ...

Jia, L. M., Yan W. G., Zhu, C. S., Agrama, ...

Jin, L., Lu, Y., Xiao, P., Sun, M., Corke, H. ...

Jun, T. H., Van, K., Kim, M. Y., Lee, S. ...

Kiani, Gh. and Nematzadeh, Gh. ۲۰۱۲. Assessment of genetic variability ...

Kovi, M. R., Hu, Y., Bai, X. and Xiang, Y. ...

Liu, L., Wang, L., Yao, J., Zheng, Y. and Zhao, ...

Maccaferri, M., Sanguineti, M. C., Demontis, A. and El-Ahmed, A. ...

Mackay, T. F., Stone, E. A. and Ayroles, J. F. ...

Mardani, Z., Rabiei, B., Sabouri, H. and Sabouri, A. ۲۰۱۳. ...

Mauricio, R. ۲۰۰۱. Mapping quantitative trait loci in plants: Uses ...

Mokrani, L., Gentzbittel, L., Azanza, F., Fitamant, L., Al-Chaarani, G. ...

Pasam, R. K., Sharma, R., Malosetti, M. and Van Eeuwijk, ...

Pritchard, J. K. and Donnelly, P. ۲۰۰۱. Case-control studies of ...

Pritchard, J. K., Stephens, M. and Donnelly, P. ۲۰۰۰. Inference ...

Rahimi, M., Rabiei, B., Ramezani, M. and Movafegh, S. ۲۰۱۰. ...

Remington, D. L., Thornsberry, J. M., Matsuoka, Y., Wilson, L. ...

Rogers, S. O. and Bendich, A. J. ۱۹۸۵. Extraction of ...

Sabouri, A., Rabiei, B., Toorchi, M., Aharizad, S. and Moumeni, ...

Semagn, K., Bjørnstad, A. and Xu, Y. ۲۰۱۰. The genetic ...

Slatkin, M. ۱۹۹۴. An exact test for neutrality based on ...

Spataro, G., Tiranti, B., Arcaleni, P. and Bellucci, E. ۲۰۱۱. ...

Triphati, K. K., Govila, O. P., Warreir, R. and Ahuja, ...

Tuberosa, R., Gill, B. S. and Quarrie, S. A. ۲۰۰۲. ...

Vanniarajan, C., Vinod, K. K. and Pereira, A. ۲۰۱۲. Molecular ...

Wen, W., Mei, H., Feng, F., Yu, S., Huang, Z., ...

Yu, J. and Buckler, E. S. ۲۰۰۶. Genetic association mapping ...

Yu, J. M., Pressoir, G., Briggs, W. H. and Bi, ...

Zheng, H., Wang, J., Zhao, H., Liu, H., Sun, J., ...

Zhu, J., Gale, M. D., Quarrie, S., Jackson, M. T. ...

Zietkiewicz, E., Rafalski, A. and Labuda, D. ۱۹۹۴. Genome fingerprinting ...

نمایش کامل مراجع