بررسی تنوع و تبارزایی جدایه های ویروس موزائیک خیار در ایران

Publish Year: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 174

This Paper With 23 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJPP-54-3_006

تاریخ نمایه سازی: 3 اسفند 1400

Abstract:

ویروس موزاییک خیار(Cucumber mosaic virus; CMV) عضوجنس Cucumovirus از خانواده Bromoviridae است. این ویروس در مقایسه به دیگر ویروسهای گیاهی دارای وسیع ترین دامنه میزبانی بوده و در ایران از مناطق مختلف گزارش شده است. در این مطالعه تنوع ژنتیکی جدایه های ایرانی این ویروس بر اساس ترادف همه ژنها بررسی و با ترادفهای همتا در جدایه های کشورهای دیگر مقایسه شده است. در این مطالعه ترادف کامل ژنوم دوجدایه از CMV از کدو(SqSh) و خربزه (MeEs) از استان های فارس و اصفهان گزارش شد. بررسی تبارزائی با هر سه آر ان ای و نیز با هر کدام از پنج ژن روی ژنوم CMV نیز نشان از قرابت بسیار نزدیک دو جدایه ی مذکور داشت. بررسی ترادفهای نوکلئوتیدی موجود نشان داد که اکثر جدایه های ایرانی که تاکنون تعیین ترادف شده اند به زیرگروه IA متعلق بودند هرچند براساس آر ان ای های ۲ و ۳ همگی یک نیای مشترک نداشتند. بر اساس نتایج این مطالعه تصور میشود که رخداد نوجوری (Reassortment) از نوع IA-IA-IB در ایجاد تنوع ژنتیکی جدایه های ایرانی نقش داشته باشد. ژن ۱a کمترین تنوع و CP بیشترین تنوع را در جدایه های ایرانی زیرگروه I نشان دادند. احتمالا مهاجرت در فواصل دور و نیز نزدیک نقشی در تکامل و ساختار ژنتیکی CMV در جدایه های ایرانی داشته است.

Authors

مریم شیروانی

کارشناسی ارشد گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران.

مجید صیام پور

استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران.

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Andika I.B. Wei S. Cao C. Salaipeth L. Kondo H. ...
  • Ben Tamarzizt H., Montarry J., Girardot G., Fakhfakh H., Tepfer ...
  • Bolou B.A., Moury B., Abo K., Sorho F., Cherif M., ...
  • Davies C. and Symons R. H. ۱۹۸۸. Further implications for ...
  • Davino S., Panno S., Rangel E.A., Davino M., Bellardi M.G., ...
  • Doolittle S. P., ۱۹۱۶. A new infectious mosaic disease of ...
  • Gibbs M.J., Armstrong J.S. and Gibbs A.J. ۲۰۰۰. Sister-scanning: a ...
  • Guindon S., Dufayard J.F., Lefort V., Anisimova M., Hordijk W. ...
  • Jacquemond M. ۲۰۱۲. Cucumber mosaic virus, pp. ۴۳۹-۵۰۴. In: Loebenstein ...
  • Kim M.K., Seo J.K., Kwak H.R., Kim J.S., Kim K.H., ...
  • Lin H.X., Rubio L., Smythe A.B. and Falk B.W. ۲۰۰۴. ...
  • Martin D.P., Murrell B., Golden M., Khoosal A. and Muhire ...
  • Nematollahi S., Sokhandan-Bashir N., Rakhshandehroo F. and Zamanizadeh H.R. ۲۰۱۲. ...
  • Nouri S., Arevalo R., Falk B.W. and Groves R.L. ۲۰۱۴. ...
  • Ohshima K., Matsumoto K., Yasaka R., Nishiyama M., Soejima K., ...
  • Palukaitis P. and Zaitlin M. ۱۹۹۷. Replicase-mediated resistance to plant ...
  • Palukaitis P., and Garcı´a-Arenal F. ۲۰۰۳. Cucumoviruses. Advances in Virus ...
  • Pressing J. and D. C. Reaney. ۱۹۸۴. Divided genomes and ...
  • Rasoulpour R., Afsharifar A. and Izadpanah K. ۲۰۱۶. Partial biological ...
  • Roossinck M. J. ۲۰۰۱. Cucumber mosaic virus as a model ...
  • Roossinck M. J., Zhang L. and Hellwald K.-H. ۱۹۹۹. Rearrangements ...
  • Salminen M.O., Carr J.K., Burke D.S. and McCutchan F.E. ۱۹۹۵.Identification ...
  • Sawyer S.A. ۱۹۹۹. GENECONV: A Computer Package for the Statistical ...
  • Sokhandan-Bashir N., Kalhor M. and Zarghani S. ۲۰۰۶. Detection, differentiation ...
  • نمایش کامل مراجع