استفاده از ژن پرآزاری سیرینگومایسین در گروه بندی جدایه هایPseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر درختان زردآلو و بادام

Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 136

This Paper With 20 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJPP-53-3_003

تاریخ نمایه سازی: 18 اسفند 1400

Abstract:

در سال­های اخیر با توجه به گسترش بیماری شانکر درختان زردآلو و بادام مشکوک به آلودگی با عامل Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) در استان آذربایجان­شرقی، جهت ردیابی و شناسایی برخی از خصوصیات فنوتیپی و ژنوتیپی جدایه­های بیمارگر Pss، نمونه­برداری از ۱۳ منطقه مختلف جغرافیایی استان انجام شد. از نمونه­های مشکوک با علایم ظاهری شانکر، تعداد ۱۴ جدایه باکتری گرم منفی و تولیدکننده رنگدانه فلورسنت، بر اساس آزمون­های بیوشیمیایی و افتراقی LOPAT و GATTa به عنوان Pss شناسایی شدند. جدایه­ها اختلاف بسیار جزیی در آزمون­های مورفولوژیکی، بیوشیمیایی و فیزیولوژیکی نشان دادند. تعیین ترادف بخشی از ناحیه ژنی rpoD، نتایج آزمون­های مورفولوژیکی و فنوتیپی را تایید نمود. جدایه­ها تفاوت معنی­داری در مهار رشد رویشی پرگنه قارچ Geotrichum candidum با تولید زهرابه داشتند. در تمامی جدایه­های Pss قطعه ۷۲۵ جفت­بازی ژن syrB دخیل در سنتز زهرابه سیرینگومایسین ردیابی گردید. جدایه­ها بر اساس آزمون بیماری­زایی روی سرشاخه­های بریده زردآلو به دو گروه پرآزار و کم­آزار تقسیم شدند. تعیین ترادف بخشی از ژن syrB و رسم تبارنما با روش بایزین نشان داد که در میان ده جدایه مورد بررسی تنوع ژنتیکی وجود داشته و جدایه­ها به دو گروه کاملا متمایز تقسیم شدند. گروه­بندی حاصله با گروه­بندی به­دست آمده بر اساس تعیین ترادف بخشی از ژن خانه­دار rpoD مشابهت داشت.

Authors

یلدا واصبی

دانشجوی دکتری پروکاریوت های بیماری زای گیاهی، گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، ایران

رضا خاک ور

دانشیار گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، ایران.

محمدمهدی فقیهی

استادیار مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی هرمزگان، ایران

بوریس ویناتزر

پروفسور گروه علوم بیماری شناسی گیاهی، فیزیولوژی و علف های هرز دانشکده کشاورزی و علوم زیستی، دانشگاه ویرجینیاتک، آمریکا.

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Abbasi V. Rahimian H. and Tajick-Ghanbari M. A. ۲۰۱۳. Genetic ...
  • Agrios G. N. ۲۰۰۵. Plant pathology. Fifth edition, Elsevier Academic ...
  • Ahmadi K. Gholizadeh H. Ebadzadeh H. Hatami F. Hoseinpoor R. ...
  • Akaike H. ۱۹۷۴. A new look at the statistical model ...
  • Aldaghi M. Rahimian H. and Mohammadi M. ۲۰۱۰. Comparison of ...
  • Al-e-Yasine S. K. and Banihashemi Z. ۱۹۹۳. Bacterial Canker of ...
  • Arrebola, E. ۲۰۰۴. Caracterización de una nueva toxina producida por ...
  • Baca S. Canfield M. L. and Moore L. W. ۱۹۸۷. ...
  • Bahar M. Mojtahedi H. and Akhyani A. ۱۹۸۲. Bacterial canker ...
  • Barzic M. R. and Guittet E. ۱۹۹۶. Structure and activity ...
  • Bender C. L. Chaidez A. and Gross D. C. ۱۹۹۹. ...
  • Bradbury J. F. ۱۹۸۶. Pseudomonas syringae pv. syringae. In: Guide ...
  • Berge O. Monteil C. L. Bartoli C. Chandeysson C. Guilbaud ...
  • Bull C. T. Clarke C. R. Cai R. Vinatzer A. ...
  • Bultreys A. and Gheysen I. ۱۹۹۹. Biological and molecular detection ...
  • Carrión V. J. van der Voort M. Arrebola E. Gutiérrez-Barranquero ...
  • Cazorla F. M. Arrebola E. Del Moral E. Rivera E. ...
  • Dariush S. Ebadi A. A. Khoshkdaman M. Rabiei B. and ...
  • De Bruijn, F. J. Rademarker J. Schneider M. Rossbach U. ...
  • Doyle J. J. and Doyle J. L. ۱۹۹۰. Isolation of ...
  • Edgar R. C. ۲۰۰۴. MUSCLE: multiple sequence alignment with high ...
  • Endert E. and Ritchie D. F. ۱۹۸۴. Detection of pathogenicity, ...
  • Fahy P. C. and Parsley G. J .۱۹۸۳. Plant Bacterial ...
  • Ferrante P. and Scortichini M. ۲۰۱۰. Molecular and phenotypic features ...
  • Fujita M. Hanaura Y. and Amemura A. ۱۹۹۵. Analysis of ...
  • Gardan L. Shafik H. Belouin S. Broch R. Grimont F. ...
  • Ghasemi A. Mohammadi M. Rahimian H. Sharifi Tehrani A. and ...
  • Grgurina I. Gross D. C. Iacobellis N. S. Lavermicocca P. ...
  • Gross D. C. and DeVay J. E. ۱۹۷۷a. Population dynamics ...
  • Gross D. C. and DeVay J. E. ۱۹۷۷b. Production and ...
  • Gross D. C. Cody Y. S. Proebsting E. L. Radamaker ...
  • Guenzi E. Galli G. Grgurina I. Gross D. C. and ...
  • Guenzi E. Galli G. Grgurina I. Gross D. C. and ...
  • Gutiérrez-Barranquero J. A. Carrión V. J. Murillo J. Arrebola E. ...
  • Hattingh M. J. and Roos I. M. M. ۱۹۹۵. Bacterial ...
  • Hutchison M. L. and Gross D. C. ۱۹۹۷. Lipopeptide phytotoxins ...
  • Hwang M. S. H. Morgan R. L. Sarkar S. F. ...
  • Ichinose Y. Taguchi F. and Mukaihara T. ۲۰۱۳. Pathogenicity and ...
  • Jones A. L. ۱۹۷۱. Bacterial canker of sweet cherry in ...
  • Jones J. B. Chase A. R. and Harris G. K.۱۹۹۳. ...
  • Kaluzna M. Ferrante P. Sobiczewiski P. and Scortichini M. ۲۰۱۰. ...
  • Kaluzna M. Janse J. D. and Young J. M. ۲۰۱۲. ...
  • Klement Z. Frakes G. L. and Loverkovich L. ۱۹۶۴. Hypersensitive ...
  • Latorre B. A. and Jones A. L. ۱۹۷۹. Pseudomonas morsprunorum, ...
  • Legard D. E. Aquadro C. F. and Hunter J. E. ...
  • Lelliott R. A. and Stead D. E. ۱۹۸۷. Methods for ...
  • Lelliott R. A. Billing E. and Hayward A. C. ۱۹۶۶. ...
  • Lonetto M. Gribskov M. and Gross C. A. ۱۹۹۲. The ...
  • Mahmoudi H. Rahnama K. Rahimian H. Nasrolahnejad S. and Taghinasab ...
  • Martín-Sanz A. de la Vega M. P. Murillo J. and ...
  • Menard M. Sutra L. Luisetti J. Prunier J. P. and ...
  • Misas-Villamil J. C. Kolodziejek I. Crabill E. Kaschani F. Niessen ...
  • Mohammadi M. Ghasemi A. and Rahimian H. ۲۰۰۱. Phenotypic characterization ...
  • Mosivand M. Rahimian H. and Shams-Bakhsh M. ۲۰۰۹. Phenotypic and ...
  • Mulet M. Lalucat J. and García-Valdés E. ۲۰۱۰. DNA sequence-based ...
  • Najafi Pour G. and Taghavi S. M. ۲۰۱۱. Comparison of ...
  • Natalini E. Rossi M. P. Barionovi D. and Scortichini M. ...
  • Nowell R. Laue B. Sharp P. M. and Green S. ...
  • Nylander J. A. A. ۲۰۰۴. MrModeltest v۲.۰. Program distributed by ...
  • Otta J. D. and English H. ۱۹۷۱. Serology and pathology ...
  • Palleroni N. J. ۱۹۸۴. Genus I. Pseudomonas (Migula ۱۹۸۴), Pp. ...
  • Parkinson N. Bryant R. Bew J. and Elphinstone J. ۲۰۱۱. ...
  • Quigley N. and Gross D. C. ۱۹۹۴. Syringomycin production among ...
  • Rannala B. and Yang Z. ۱۹۹۶. Probability distribution of molecular ...
  • Ravindran A. Jalan N. Yuan J. S. Wang N. and ...
  • Ronquist F. Teslenko M. van der Mark P. Ayres D. ...
  • Sănchez D. Matthijs S. Gomila M. Tricot C. Mulet M. ...
  • Sands D. C. Schoth M. N. and Hildebrand D. C. ...
  • Sarkar S. F. and Guttman D. S. ۲۰۰۴. The evolution ...
  • Schaad N. W. Jones J. B. and Chun W. ۲۰۰۱ ...
  • Schellenberg B. Ramel C. and Dudler R. ۲۰۱۰. Pseudomonas syringae ...
  • Sinden S. L. DeVay J. E. and Backman P. A. ...
  • Słomnicka R. Olczak-Woltman H. Bartoszewski G. and Niemirowicz-Szczytt K. ۲۰۱۵. ...
  • Sorensen K. N. Kim K. H. and Takemoto J. Y. ...
  • Tamura K. Stecher G. Peterson D. Filipski A. and Kumar ...
  • Wang N. Lu S. E. Yang Q. Sze S. H. ...
  • Xu G. W. and Gross D. C. ۱۹۸۸. Evaluation of ...
  • Yamamoto S. Ksai H. Arnold D. L. Jackson R. W. ...
  • Young J. M. ۱۹۹۱. Pathogenicity and identification of the lilac ...
  • Young J. M. ۲۰۱۰. Taxonomy of Pseudomonas syringae. Journal of ...
  • Zhang J. H. Quigley N. B. and Gross D. C. ...
  • Zhang J. H. Quigley N. B. and Gross D. C. ...
  • نمایش کامل مراجع