تاثیر دما بر شدت بیماری ناشی از ویروس های موزائیک کوتولگی ذرت و موزائیک جنوبی مرغ

پوتی ویروس های موزائیک جنوبی مرغ  (Bermuda grass southern mosaic virus, BgSMV) و موزائیک کوتولگی ذرت (Maize dwarf mosaic virus, MDMV)  با وجود  شباهت هایی، به لحاظ پراکنش جغرافیایی و وجود قطعه ۹۰ نوکلئوتیدی اضافی در ناحیه ۵' ژن پروتئین پوششی BgSMV  با هم اختلاف دارند. در این پژوهش تاثیر تغییر دما بر روی شدت بیماری ناشی از  BgSMV  و MDMV مورد بررسی قرار گرفت و قطعه ۹۰ نوکلئوتیدی در  ژن پروتئین پوششی BgSMV به کمک نرم افزارهای بیوانفورماتیک بررسی و مقایسه شد. آزمایش به صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملا تصادفی با دو فاکتور دما در سه سطح (۲۵، ۳۰ و ۳۵ درجه سانتیگراد) و اینوکولوم در سه سطح (BgSMV، MDMV و بافر مایه زنی) و شش تکرار انجام گردید. شدت بیماری، دوره نهفتگی و شاخص های رشد شامل ارتفاع گیاه از سطح خاک و وزن گیاه در پایان روز سی ام پس از مایه زنی اندازگیری شد. نتایج نشان داد شدت بیماری ناشی از MDMV در دماهای مورد مطالعه، اختلاف معنی داری نداشت در حالی که شدت بیماری ناشی از BgSMV  با افزایش دما روند صعودی داشت. همچنین با افزایش دما  طول دوره نهفتگی MDMV   کاهش یافت. براساس تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک در قسمت انتهای آمینی پروتئین پوششی BgSMV و MDMV یک ناحیه فعال در بیان ژن و تحمل به دمای بالا موسوم به coiled-coil region وجود دارد که در BgSMV به اندازه ۳۰  آمینواسید بلند تر از ناحیه مشابه درMDMV   است.

Keywords:

بیوانفورماتیک , پروتئین پوششی , پوتی ویروس ها , مرغ , ذرت