شناسایی ژن های مرتبط با گرهزایی در گیاه لوتوس بورتیایی در آلودگی با باکتری نیمه همزیست (Rhizobiom leguminosarum)

همزیستی بین گیاه و باکتری با تشکیل گره و تثبیت نیتروژن بر کمیت محصول و همچنین محتوای پروتئین گیاه دارای اهمیتبسیار زیادی می باشد. در این پژوهش جهت شناسایی ژن های باکتریایی مرتبط با تولید گره، تعداد ۱۹۴ سویه باکتریRhizobiom leguminosarum (نیمه همزیست) با گیاه لوتوس بورتیایی (Lotus burttii) مورد استفاده قرار گرفت. مطالعهارتباطی سرتاسری ژنوم (GWAS) با استفاده از داده های حضور و عدم حضور ۷۰۹۴ ژن در سویه های این باکتری جهتشناسایی ژن های مرتبط با گره زایی قرمز انجام گرفت. در ادامه، امکان جداسازی ۴ اپرون احتمالی در ۱۰۰ ژن اول وجودداشت، و از آنجا که که دو اپرون اول دارای ارزش p بالاتر و سهم از واریانس بیشتری نسبت به دو اپرون دیگر داشت وبه عنوان اپرون های موثر بر گره زایی شناسایی شد؛ که دارای اثر منفی بر تعداد گره قرمز بودند. موتانت حاصل از این دو اپروننشان داد که اپرون اول دارای اثر مثبت بر تعداد گره قرمز در گیاه لوتوس بورتیایی بوده در حالیکه عدم حضور اپرون دومتفاوت آماری معنی داری در مقایسه با تیپ وحشی ایجاد نکرد.

Keywords:

تثبیت نیتروژن , همزیستی , GWAS