آنالیز ترادف نوکلئوتیدی جدایه ایرانی ویروس موزائیک کوتولگی ذرت و بررسی منشاء و تکامل آن

ترادف کاملنوکلئوتیدی جدایه ایرانی ویروس موزائیک کوتولگی ذرت (Maize dwarf mosaic virus MDMV-Ir) تعیین گردید. ژنوم ویروس بجز دنباله Poly A انتهایی ʹ۳، ۹۴۹۹ نوکلئوتید بود که شامل ۱۳۹ نوکلئوتید ناحیه خوانده نشدنی ʹ ۵ و ۲۳۴ نوکلئوتید ناحیه خوانده نشدنی ʹ ۳ و یک چارچوب باز خواندنی که یک پلی پروتئین با ۳۰۴۲ اسید آمینه را کد می کند را شامل می شد. MDMV-Ir  با سایر جدایه های ویروس۴/۸۶ تا ۹/۹۱ در صد شباهت نوکلئوتیدی و ۹/۹۳ تا ۳/۹۷ در صد شباهت آمینواسیدی دارد. شباهت نوکلئوتیدی MDMV-Ir  با ترادف کامل سایر پوتی ویروس های غلات موجود در GenBank ۵۴ تا ۵/۷۰ در صد محاسبه گردید. ترادف آمینو اسیدی پروتئین های ویروس با  پروتئین های سایر ویروس های غلات ۸/۲۹ تا ۶۰ در صد مشابهت نشان داد. مقایسه ترادف  نوکلئوتیدی و آنالیز فیلوژنتیکی ترادف کامل و پلی پروتئین های حاصله نشان داد که  MDMV بیشترین شباهت را با جدایه بلغاری ویروس و در بین پوتی ویروس های غلات بیشترین شباهت را ویروس موزائیک سورگوم دارد. همچنین این آنالیز نشان داد که جمعیت های MDMV یک گروه مونوفیلتیک هستند که از ناحیه مدیترانه منشاء گرفته اند.

Keywords:

ویروس موزائیک کوتولگی ذرت , ناحیه مدیترانه , منشاء ویروس , ایران