واکاوی مولکولی برخی نژادگان های انبه جنوب ایران براساس ناحیه بین ژنی trnH-psbA
Publish Year: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 231
This Paper With 17 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IRSHS-22-4_006
تاریخ نمایه سازی: 25 اردیبهشت 1401
Abstract:
انبه یکی از مهمترین میوه های قاره آسیا و مناطق گرمسیر و نیمه گرمسیر دنیاست. در پژوهش حاضر تنوع ژنتیکی درون گونه ای ۳۰ نژادگان انبه از برخی مناطق دو استان جنوب کشور، کرمان و هرمزگان (رودان، منوجان، فاریاب، جیرفت، عنبرآباد، هیشین، دهکهان و بلوک) از راه ارزیابی ناحیه بین ژنی trnH-psbA کلروپلاست مورد بررسی قرار گرفت. پس از نمونه برداری از برگ های جوان، استخراج DNA و PCR با استفاده از آغازگرهای ژن trnH-psbA(IGS) انجام شد. محصولات تکثیر شده مربوط به هر یک از نژادگان های مورد مطالعه، پس از تعیین توالی در پایگاه داده NCBI ثبت شدند. واکاوی ها و ترسیم دندروگرام روابط فیلوژنتیک و ماتریس تشابه توالی ها با نرم افزارهای Darwin، Popgene و Mega انجام شد تا روابط خویشاوندی و فاصله ژنتیکی بین نژادگان ها تعیین شود. تجزیه توالی ها نشان داد که در ناحیه بین ژنی trnH-psbA در مجموع ۳۶۱ جایگاه شناسایی شد. بررسی شباهت توالی نمونه های انبه مورد بررسی با یکدیگر نشانگر یک توالی مشترک ۱۱۶ جفت بازی در میان آن ها بود. براساس دندوگرام حاصل از تجزیه خوشه ای، نژادگان ها در چهار گروه مختلف قرار گرفتند. بر اساس نتیجه های حاصل می توان نتیجه گرفت که استفاده از ناحیه بین ژنی trnH-psbA برای مطالعه و شناخت تنوع و روابط درون گونه ای انبه مفید بوده است.
Keywords:
Mango , Intraspecific genetic variation , DNA barcoding , Phylogenetic relationships , Chloroplast markers , انبه , تنوع ژنتیکی درون گونه ای , DNA بارکدینگ , روابط فیلوژنتیک , نشانگر کلروپلاستی
Authors
عزیزالله شیرزایی
دانشگاه زابل
محمود سلوکی
دانشگاه زابل
لیلا فهمیده
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :