شناسایی و تنوع ژنتیکی جدایه هایPseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار در چند استان شمالی و مرکزی ایران

بیماری شانکر باکتریایی هسته داران با عامل (Pss) Pseudomonas syringae pv. syringae یکی از بیماری های شایع درختان میوه هسته دار در استان های شمالی و مرکزی ایران می باشد. به منظور شناسایی جدایه های عامل بیماری، طی سال های ۱۳۹۰-۱۳۸۹، ۱۰۵ جدایه به دست آمده از باغ های درختان میوه هسته دار واقع در مناطق مختلف استان های اردبیل، آذربایجان شرقی، گیلان، مازندران، خراسان رضوی، تهران و قزوین از نظر فنوتیپی، بیماری زایی و الکتروفورز پروتئین های سلولی و وجود ژن سرینگومایسین (syrB) مورد بررسی قرار گرفتند. جدایه ها از نظر ویژگی های فنوتیپی و الگوی پروتئین های سلولی اختلاف های جزئی نشان دادند. همه جدایه ها روی هلو دارای قدرت بیماری زایی بالایی بودند و از این نظر مشابه به نظر رسیدند. همه ی جدایه ها به همراه جدایه ی استاندارد، قطعه ی ۷۵۲ جفت بازی با آغازگر syrB را تکثیر کردند. تنوع ژنتیکی بین جدایه ها با دو روش BOX-PCR و IS۵۰-PCR بررسی شد. آنالیز خوشه ای نتایج به دست آمده نشان داد که در BOX-PCR در سطح تشابه ۷۳ درصد، جدایه ها به ۹ گروه و با IS۵۰-PCR به ۸ گروه و با ترکیب همه آغازگرها به ۱۱ گروه تقسیم شدند. بین تنوع ژنتیکی جدایه ها و منشا جغرافیایی آنها ارتباط معنی داری وجود نداشت. نتایج نشانگر وجود تنوع ژنتیکی بالا درون جدایه های مختلف Pss عامل بیماری شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار بود. در این بررسی ارتباط مشخصی بین منشا جغرافیایی جدایه ها و گروه های حاصل از بررسی تنوع ژنتیکی آنها مشاهده نشد

Keywords:

شانکر باکتریایی هسته داران , Pseudomonas syringae pv. syringae , تنوع ژنتیکی , BOX-PCR , IS۵۰-PCR