ارزیابی تنوع ژنتیکی در نمونه های دو گونه جو (L. H. vulgare و.H. spontaneum L. ) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
Publish place: Iranian Journal of Crop Sciences، Vol: 12، Issue: 3
Publish Year: 1389
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 250
This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_AGRO-12-3_009
Index date: 14 July 2022
ارزیابی تنوع ژنتیکی در نمونه های دو گونه جو (L. H. vulgare و.H. spontaneum L. ) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره abstract
در این آزمایش تنوع ژنتیکی ۷۳ نمونه جو ایران از دو گونه H. vulgare و H. spontaneum با استفاده از ۱۵ جفت نشانگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. الگو های نواری بصورت صفر (عدم وجود باند) و یک (وجود باند) امتیاز دهی شدند. برای رسم دندروگرام ابتدا ماتریس تشابه با روش دایس تشکیل و سپس دندروگرام با استفاده از الگوریتم UPGMA با نرم افزار NTSYSpc ۲.۰ رسم شد. همچنین از این نرم افزار برای رسم پراکنش نمونه ها در دو بعد اول تجزیه به مختصات اصلی (PCoA) نیز استفاده شد. بیشترین تعداد آلل در گونه H. vulgare مربوط به جایگاه های Bmac۰۳۱۶ و Hvm۴۰ با ۸ آلل و کمترین آن مربوط به جایگاه Hvm۷۰ با دو شکل بود. بیشترین تعداد آلل در گونهH. spontaneum مربوط به جایگاه Hvm۴۰ (با ۹ آلل) و کمترین آن مربوط به جایگاه های Hvm۷۰ و HvmLoH۱A (با ۲ آلل) بود. میزان PIC درگونه H. vulgare
از۸۰/۰ (جایگاه Bmac۰۰۴۰) تا ۱۹/۰ (جایگاه Bmag۰۶۰۳) و در گونه H. spontaneum از ۹۱/۰ (جایگاه Bmac۰۴۱۵) تا ۰۴۳/۰ (جایگاه Hvm۷۰) متغیر بود. تجزیه خوشه ای با استفاده از ضریب دایس و الگوریتم UPGMA نمونه ها را به سه گروه تقسیم کرد. گروه اول شامل نمونه هایی از هر دو گونه H. spontaneum و H. vulgare که از ایران جمع آوری شده اند و گروه های دوم و سوم نیز به ترتیب شامل نمونه هایی از گونه های H. spontaneum و H. vulgare بود. نتایج حاصل از تجزیه به مختصات اصلی با نتایج حاصل از تجزیه خوشه ای همخوانی داشت. نتایج این تحقیق نشان داد که نشانگرهای ریزماهواره برای بررسی تنوع در هر
دو گونهH. spontaneum و H. vulgare مفید می باشند. جایگاه های HvmLoH۱A و Ebmac۰۴۱۵ در
گونه H. spontaneum و جایگاه های Bmac۰۳۰۶ و Bamc۰۰۴۰ در گونه H. vulgare برای بررسی تنوع در این گونه ها مناسب تشخیص داده شدند.
ارزیابی تنوع ژنتیکی در نمونه های دو گونه جو (L. H. vulgare و.H. spontaneum L. ) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره Keywords:
Barley , Genetic diversity , SSR markers , H. spontaneum L. and H. vulgare L , تنوع ژنتیکی , جو , نشانگر های ریز ماهواره , H. spontaneumو H. vulgare.
ارزیابی تنوع ژنتیکی در نمونه های دو گونه جو (L. H. vulgare و.H. spontaneum L. ) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره authors
امین ابراهیمی
پردیس کشاورزی و منابع طبیعی د انشگاه تهران
محمدرضا نقوی
پردیس کشاورزی و منابع طبیعی د انشگاه تهران
منی‍ژه سبکدست
پردیس کشاورزی و منابع طبیعی د انشگاه تهران
محسن مردی
پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی، کرج