ارزیابی تنوع ژنتیکی در ژنوتیپ های کینوا (.Chenopodium quinoa Willd) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
Publish place: Iranian Journal of Crop Sciences، Vol: 24، Issue: 4
Publish Year: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 163
This Paper With 15 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_AGRO-24-4_005
تاریخ نمایه سازی: 18 اردیبهشت 1402
Abstract:
به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی جهت استفاده در تحقیقات بعدی، در این پژوهش تنوع ژنتیکی ۶۰ ژنوتیپ کینوا وارداتی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره در سال ۱۴۰۰ در دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج ارزیابی های فنوتیپی ژنوتیپهای کینوا نشان داد که تنوع نسبتا بالایی در بین آنها وجود داشت که در بین صفات مورد بررسی بهترتیب صفات عملکرد دانه در بوته (۸/۴۲) و تعداد روز تا خمیری شدن دانه (۱۴/۸) بیشترین و کمترین مقدار ضریب تغییرات فنوتیپی را داشتند. ارزیابی تنوع مولکولی ژنوتیپها با استفاده از ۴۰ جفت نشانگر ریزماهواره، تعداد ۱۳۶ باند چندشکل تولید کرد و میانگین تعداد آلل های موثر (۸۱/۱)، محتوای اطلاعات چندشکلی (۶۰/۰)، شاخص شانون (۵۴/۰) و تنوع ژنی نی (۴۴/۰)، وجود تنوع بالا در بین ژنوتیپهای کینوا را مورد تایید قرار داد. نشانگرهای KAAT۰۲۷، KAAT۰۳۶، KAAT۰۴۰، KCAA۰۱۴، KGA۰۴۲، KGA۰۵۵ و KGA۰۵۹ با پنج آلل چندشکل، بیشترین تعداد آلل چندشکل را در بین نشانگرهای مورد استفاده داشتند. میانگین تعداد آللهای موثر نشانگرهای ریزماهواره در ژنوتیپهای کینوا ۸۱/۱ آلل بود و نشانگرهای KAAT۰۲۷ و KAAT۰۰۶ با ۷۵/۳ و ۰۸/۱ آلل،
بهترتیب بیشترین و کمترین تعداد آلل موثر را نشان دادند. تجزیه خوشهای با استفاده از روش UPGMA، ۶۰ ژنوتیپ کینوا را در دو زیرجمعیت با ۳۸ و ۲۲ ژنوتیپ گروهبندی کرد. با توجه به اینکه یکی از معیارهای مهم در انتخاب نشانگرهای مناسب و سودمند، تعداد آلل موثر است، بنابراین میتوان از نشانگرهای با تعداد آلل موثر بیشتر شامل KAAT۰۲۷، KAAT۰۳۶ و KAAT۰۴۰ (هر سه با بیش از سه آلل موثر)، برای بررسی تنوع ژنتیکی در ژنوتیپهای کینوا در پژوهشهای آتی استفاده کرد.
Keywords:
Cluster analysis , Microsatellite markers , Polymorphic information content , Population structure and Quinoa , تجزیه خوشه ای , ساختار جمعیت , کینوا , محتوای اطلاعات چندشکل و نشانگر ریزماهواره
Authors
ابراهیم سوری لکی
University of Guilan, Rasht, Iran
بابک ربیعی
University of Guilan, Rasht, Iran
وحید جوکار فرد
University of Guilan, Rasht, Iran
حسن مرعشی
Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :