سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

بررسی مقایسه­ ای سه روش استخراج DNA ژنومی از نمونه­ های تازه و گیاکده ­ای برگ بومادران کوتاه دشتی

Publish Year: 1397
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 180

This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download

Export:

Link to this Paper:

Document National Code:

JR_NBR-5-4_013

Index date: 29 November 2023

بررسی مقایسه­ ای سه روش استخراج DNA ژنومی از نمونه­ های تازه و گیاکده ­ای برگ بومادران کوتاه دشتی abstract

استخراج DNA از بافت­های گیاهی اغلب مشکلاتی را فراهم می­سازد. بطورمثال عدم حذف متابولیت­های ثانویه نظیر ترکیبات فنلی گیاهان معطر و دارویی، باعث بروز خطا در نتایج کاربرد DNA استخراج شده طی آزمایش های مولکولی می­شود. بومادران (Achillea wilhelmsii)، گیاهی دارویی متعلق به تیره کاسنیان (Asteraceae) و انحصاری ایران است که اطلاعات کمی در رابطه با ژنوم آن وجود دارد. بدین جهت بهینه­سازی روش­های استخراج برای تهیه DNA با کمیت و کیفیت مناسب ضروری به نظر می­رسد. در این مطالعه دو روش سنتی استخراج DNA ژنومی از برگ گیاه بومادران (با استفاده از بافت تازه و گیاکده­ای) و یک روش دیگر با استفاده از کیت استخراج تجاری MAGNANTM مورد مقایسه قرار گرفته است. نتایج نشان داد که استخراج DNA از برگ­های تازه طبق دستورالعمل Khanuja و همکاران (۱۹۹۹) به دلیل افزایش مقدار DNA استخراج شده و کاهش آلودگی ترکیبات مزاحم مثل RNA، پلی­ساکاریدها، پروتئین­ها و متابولیت­های ثانوی بهتر از دو روش دیگر بود. ارزیابی کیفیت DNA استخراج شده از نمونه­های گیاکده­ای نشان داد که علیرغم مقدار بالای DNA (۵۰-۱۰ برابر نسبت به دو روش دیگر)، کیفیت عصاره روی ژل آگارز بخاطر وجود کشیدگی و شکستگی مولکول DNA پایین بود. این امر می­تواند استفاده از عصاره فوق را در آزمایشهای مولکولی با محدودیت روبرو سازد. کاربرد کیت استخراج MAGNANTM گرچه از نظر کاهش زمان و هزینه استخراج و کاهش آلودگی به پروتئین و RNA مناسب بود، اما نیازمند اصلاح فرایند تخلیص برای گیاه بومادران جهت افزایش کمیت DNA حاصل است.

بررسی مقایسه­ ای سه روش استخراج DNA ژنومی از نمونه­ های تازه و گیاکده ­ای برگ بومادران کوتاه دشتی Keywords:

بررسی مقایسه­ ای سه روش استخراج DNA ژنومی از نمونه­ های تازه و گیاکده ­ای برگ بومادران کوتاه دشتی authors

Azra Saboora

alzahra university

Maryam Amiri Rad

alzahra university

Ezat Asgarani

alzahra university

Tayebeh Radjabian

shahed university

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Alaey, M., Nader, R., Khalighi, A., Vezvaeoi, A. and Salami, ...
Asgary, S., Naderi, G.H., Sarrafzadegan, N., Mohammadifard, N., Mostafavi, S. ...
Bushra, C., Afshan, Y., Tayyab, H. and Riazuddin, S. ۱۹۹۹. ...
Cheng, Y.J., Guo, W.W., Yi, H.L., Pang, X.M. and Deng, ...
Costa, C.M. and Roberts, R.P. ۲۰۱۴. Techniques for improving the ...
Cota-Sánchez, J.H., Remarchuk, K. and Ubayasena, K. ۲۰۰۶. Ready to ...
Del Serrone, P., Attorri, L. and Palazzino, G. ۲۰۰۷. Easy ...
Dellaporta, S.L., Wood, J. and Hicks, J.B. ۱۹۸۳. A plant ...
Desjardins, P. and Conklin, D. ۲۰۱۰. NanoDrop Microvolume Quantitation of ...
Drábková, L.Z. ۲۰۱۴. DNA extraction from herbarium specimens. – Methods ...
Gaudeul M, and Rouhan G. ۲۰۱۳. A plea for modern ...
Kadkhodaie, A. ۲۰۰۳. A simple and low cost method for ...
Khanuja, S.P.S., Shasany, A.K., Darokar, M.P. and Kumar, S. ۱۹۹۹. ...
Komatsuda, T., Nakamura, I., Takaiwa, F. and Oka, S. ۱۹۹۸. ...
Lakshmi, T., Geetha, R.V., Roy, A. and Kumar, S.A. ۲۰۱۱. ...
Lickfeldt, D.W., Hofmann, N.E., Jones, J.D., Hamblin, A.M. and Voigt, ...
Murashige, T. and Skoog, F. ۱۹۶۲. A revised medium for ...
Pirttila, A.M., Hirsikorpi, M., Kamarainen, T., Jaakola, L. and Hohtola, ...
Porebski, S.L., Baily, G. and Baum, B.R. ۱۹۹۷. Modification of ...
Rahim Malek, M. ۲۰۱۱. Investigating and comparing different methods of ...
Rahnama, H., Sattarzadeh, A., Kazemi, F., Ahmadi, N., Sanjarian, F. ...
Sameer, S.A., Ul Rehman S., Banday, M.Z., Syeed, N., Pandit, ...
Varadarajan, G.S. and Prakash, C.S. ۱۹۹۱. A rapid and efficient ...
Viana, J.P.G., Borges, A.N.C., Lopes, A.C.A., Gomes, R.L.F., Britto, F.B., ...
Zabeti, S.M., Ismaili, A., Madah-Arefi, H., Nazarian-Firouzabadi, F. and Mojiri, ...
Zamani, Z., Sarkhoush, A., Fatahi Moghadam, M.R. and Ebadi, A. ...
Zhoua, L.G. and Wu, J.U. ۲۰۰۶. Development and application of ...
نمایش کامل مراجع