بررسی تغییرات بیان ژن های دخیل در بروز سرطان کارسینوم سلول های سنگفرشی دهان مطالعه متا آنالیزی

کارسینوم سلول های سنگفرشی دهان شایع ترین سرطان دهان است .برای این مطالعه یک گروه داده بیان ژن طبق ریز آرایه از پایگاه عمومی (GEO) Gene Expression Omnibus NCBI یافت شده که از عدد های الحاقی ژن برای مجموعه ی داده های بدست آمده در بردارنده ی GSE۲۱۵۷۶۷ با GPL۲۳۱۷۸ که حد واسط چند آرایه ای قوی RNA برای تبدیل کردن Log۲، نرمال سازی و تصحیح پس زمینه که از قبل پردازش شده برای بررسی توسطarray qualitymctrics در R تحقق یافتند.بر اساس آنالیز هایی که بررسی کردیم در سرطان کارسینوم سلول های سنگفرشی دهان در مسیر های سیگنالینگ مختلف، ژن ها و مسیر ژن هایی که باعث افزایش بیان می شود را مورد بررسی قرار دادیم که یکسان با تحقیقاتی که از پیش صورت گرفته شده، است. طبق آنالیز بدست آمده در بافت تومور نسبت به حاشیه تومور با در نظر گرفتن LogFC<۰.۷ >-۰.۷وP-Value<۰.۵ زیاد شدن بیان ارتباط معناداری بین داده های بدست آمده است. هدف از مطالعه ی ما بررسی متاآنالیز RNA های غیر کد کننده طولانی و mRNA در بافت تومور و حاشیه ی تومور مبتلایان به سرطان کارسینوم سلول های سنگفرشی دهان که با توجه به داده ها بافت تومور نسبت به حاشیه ی تومور افزایش بیان دارد.

Keywords:

کارسینوم سلول های سنگفرشی دهان (OSCC) , RNA های غیر کد کننده طولانی (LncRNAs) , mRNA , متاآنالیز