آنالیز بیوانفورماتیکی ارتباط تکاملی آنزیم PAL بین دو جنس Petroselinum crispum و Rhodosporidium toruloides
Publish place: 3rd Iranian Agricultural Biotechnology Conference
Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 901
متن کامل این Paper منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل Paper (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
AGRIBIOTECH03_065
تاریخ نمایه سازی: 27 تیر 1392
Abstract:
در این مطالعه آنزیم PAL Phenylalanine ammonia lyase به عنوان یکی از آنزیم های کلیدی شناخته شده در مسیر سنتز فنیل پروپانوئید به منظور درک چین خوردگی ساختاری و همولوژی توالی مورد ارزیابی قرار گرفت، بطوری که ساختارهای کریستالوگرافی اشعه ایکس Rhodosporidium 1T6J toruloides به عنوان جنسی از رده قارچ ها و27 1W Petroselinum crispum به عنوان جنسی از رده گیاهان از پایگاه اطلاعاتی PDB (Protein Data Bank) استخراج گردید. به منظور آنالیز ساختاری و دمین های این آنزیم از نرم افزارهای Protein Structure Comparison Tool V 1.4 و نسخه on-web PDBe بر مبنای الگوریتم های SSM و CE جهت مطالعه هم ردیفی ساختاری (Structure Alignment) و محاسبه شاخص های آماری نظیر Q-score ، p-value ، Z-score و غیره استفاده گردید. در نهایت شاخص های محاسبه شده بین دو پروتئین PAL (1T6J & W27 1 رابطه معنی داری از لحاظ شباهت چین خوردگی ساختاری و همولوژی جزئی بین توالی های ساختارهای فوق را نشان می دهد.
Keywords:
Authors
مازیار بحرینی
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی،دانشگاه
فریدون بنداریان
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی،دانشگاه آزاد اس
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :