سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

بهینه سازی روش استخراجRNA از بافت پوست شاخه درختان خانواده مخروطیان

Publish Year: 1395
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 69

This Paper With 12 Page And PDF Format Ready To Download

Export:

Link to this Paper:

Document National Code:

JR_IJRFP-24-1_009

Index date: 19 September 2024

بهینه سازی روش استخراجRNA از بافت پوست شاخه درختان خانواده مخروطیان abstract

فرآیند استخراج RNA از بافت­های سخت چوبی و به­طور خاص درختان خانواده مخروطیان به‎دلیل داشتن غلظت­های بالایی از ترکیبات فنولیک، پلی­ساکاریدها، متابولیت­های ثانویه و لیگنین، بسیار مشکل است و تا به‎حال هیچ­گونه کیت تجاری برای این منظور ساخته نشده است. در این مطالعه مشکلات فوق برطرف گردیده و روشی سریع، ساده و اقتصادی برای استخراج RNA از بافت ساقه گونه های Cedrus deodara و Abies grandis که هر دو از خانواده مخروطیان می­باشند، ارائه شده است. نسبت جذب نوری در طول موج های ۲۶۰ به ۲۸۰ و ۲۶۰ به ۲۳۰ نانومتر، به‎ترتیب ۸۸/۱ و ۱/۱ برای گونه  Cedrus deodara و ۸/۱ و ۹/۰ برای گونه Abies grandis به‎دست آمد. تغییرات صورت گرفته در جهت بهینه سازی استخراج RNA نیز شامل استفاده از تیمار پیش گرما روی بافر استخراج، کاهش دور سانتریفیوژ حذف آلودگی DNA و حذف DEPC می باشد. ساخت cDNA با استفاده از RNA استخراج شده با موفقیت انجام و واکنش RT-PCR باندهای مورد انتظار را تولید نمود. لذا به­نظر می­رسد این روش برای استخراج RNA از بافت­های چوبی مناسب است.

بهینه سازی روش استخراجRNA از بافت پوست شاخه درختان خانواده مخروطیان Keywords:

بهینه سازی روش استخراجRNA از بافت پوست شاخه درختان خانواده مخروطیان authors

faeezeh haeerizadeh

دانشجوی کارشناسی ارشد، اصلاح نباتات، دانشگاه یاسوج، یاسوج

asad masoomi asl

نویسنده مسئول مکاتبات، استادیار، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج پست الکترونیک: Masoumiasl@yu.ac.ir

pezhman azadi

استادیار، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج

hamid rajabi-memari

استادیار، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران، اهواز

nafiseh aboofazeli

عضو شرکت دانش بنیان زیست فناوران نوین گیتی ژن، تهران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Asif, M.H., Dhauan, P. and Nath, P., ۲۰۰۰. A simple ...
Baker, J.T., Sanders, A.L., Maccotta, L. and Buckner, R.L., ۲۰۰۱. ...
Bell, D.A. and DeMarini, D., ۱۹۹۱. Excessive cycling converts PCR ...
Beutler, E., Gelbart, T. and Kuhl, W., ۱۹۹۰. Interference of ...
Brown, T.A., ۲۰۰۶. Gene cloning an introduction. Translated by: AhmadianTehrani, ...
Budavari, S., ۱۹۹۶. The Merck index- Encyclopedia of chemicals, Drugs ...
Cara, A., Gambino, G. and Schubert, A., ۲۰۰۷. A cetylmethylammonium ...
Chang, S., Puryear, J. and Carney, J., ۱۹۹۳. A simple ...
Claros, M.G. and Canovas, F.M., ۱۹۹۸. Rapid high quality RNA ...
Dean, W.L. and C. Tanford. ۱۹۷۸. Properties of a delipidated ...
Fu, X., Deng, S., Su, G., Zeng, Q. and Shi, ...
Gasic, K., Hernandez, A. and Korban, S., ۲۰۰۴. RNA extraction ...
Gelrig, H.H., Winter, K., Cusman, J., Borland, A. and Taybi, ...
Harsiah, C., Namasivayam, P. and Mohamed, R., ۲۰۱۲. Comparisons of ...
Hoppe, B.L., Conti-Tronconi, B.M. and Horton R.M., ۱۹۹۲. Gel-loading dyes ...
Kainz, P., ۲۰۰۰. The PCR plateau phase-towards an understanding of ...
Kamaloddini, H., Solooki, M., Riginegad, N. and Haddadi, F., ۲۰۰۶. ...
Kolosava, N., Miller, B., Ralph, S., Elis, B.E., Douglas, C., ...
Ky, H., Yeap, S.K. and Napis, S.B., ۲۰۱۲. The best ...
Le Provast, G., Herrera, R., Pavia, G., Chaumeil, P., Salin, ...
Lewinsohn, E., Steele, C.L. and Croteau, R., ۱۹۹۴. Simple isolation ...
Loomis, W.D., ۱۹۷۴. Overcoming problems of phenolics and quinones in ...
Lorenz, W.W., Yu, Y.S. and Dean, J.F.D., ۲۰۱۰. An improved ...
Mousazade Moghadam, M., Babavalian, H., Mirnejad, R. and Shakeri, F., ...
Paula, M.F.B., Sagio, S.A., Lazzari, F., Barreto, H.G., Pavia, L.V. ...
Powell, L.M., Wallis, S.C., Pease, R.G., Edwards, Y.H., Knott, T.J. ...
Reid, K.E., Olsson, N., Schlosser, J., Peng, F. and Lund, ...
Rodrigues, S.M., Soares, V.L., De Oliveira, T.M., Gesteira, A.S., Otoni, ...
Roux, K.H., ۲۰۰۹. Optimization and Trouble shooting in PCR. Cold ...
Rubio-Pina, J. and Zapata-Perez, O., ۲۰۱۱. Isolation of total RNA ...
Saiki, R.K., Scharf, S., Faloona, F., Mullis, K., Glenn, B., ...
Sambrook, J. and Russel, D.W., ۲۰۰۱. Molecular Cloning: A laboratory ...
Sarkar, G., Kapelner, S. and Sommer, S.S., ۱۹۹۰. Formamid can ...
Schneiderbauer, A., Sanderman H.Jr. and Ernst, D., ۱۹۹۱. Isolation of ...
Steele, C.L., Katoh, S., Bolmann, J. and Croteau, R.,۱۹۹۸. Regulation ...
Sullivan, D., Fahey, B. and Titus, D., ۲۰۰۶. Fast PCR: ...
Sun, Y., Hegamyer, G. and Colburn, N.H.,۱۹۹۳. PCR-directed sequencing of ...
Tattersall, E.A.R., Ergul, A., Alkayal, F., Deluc, L., Cushman, J.C. ...
Vasanthaiah, H.K.N., Katam, R. and Sheikh, M.B., ۲۰۰۸. Efficient protocol ...
Wang, T., Zhang, N. and Du, L., ۲۰۰۵. Isolation of ...
Warner, M.A. and Harper, J.V., ۱۹۸۵. Cardiac dysrhythmias associated with ...
Weyant, R.S., Edmonds, P. and Swaminathan, B., ۱۹۹۰. Effect of ...
Yang, G., Zhou, R., Tang, T. and Shi, S., ۲۰۰۸. ...
نمایش کامل مراجع