بهینه سازی روش استخراجRNA از بافت پوست شاخه درختان خانواده مخروطیان

Publish Year: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 38

This Paper With 12 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJRFP-24-1_009

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1403

Abstract:

فرآیند استخراج RNA از بافت­های سخت چوبی و به­طور خاص درختان خانواده مخروطیان به‎دلیل داشتن غلظت­های بالایی از ترکیبات فنولیک، پلی­ساکاریدها، متابولیت­های ثانویه و لیگنین، بسیار مشکل است و تا به‎حال هیچ­گونه کیت تجاری برای این منظور ساخته نشده است. در این مطالعه مشکلات فوق برطرف گردیده و روشی سریع، ساده و اقتصادی برای استخراج RNA از بافت ساقه گونه های Cedrus deodara و Abies grandis که هر دو از خانواده مخروطیان می­باشند، ارائه شده است. نسبت جذب نوری در طول موج های ۲۶۰ به ۲۸۰ و ۲۶۰ به ۲۳۰ نانومتر، به‎ترتیب ۸۸/۱ و ۱/۱ برای گونه  Cedrus deodara و ۸/۱ و ۹/۰ برای گونه Abies grandis به‎دست آمد. تغییرات صورت گرفته در جهت بهینه سازی استخراج RNA نیز شامل استفاده از تیمار پیش گرما روی بافر استخراج، کاهش دور سانتریفیوژ حذف آلودگی DNA و حذف DEPC می باشد. ساخت cDNA با استفاده از RNA استخراج شده با موفقیت انجام و واکنش RT-PCR باندهای مورد انتظار را تولید نمود. لذا به­نظر می­رسد این روش برای استخراج RNA از بافت­های چوبی مناسب است.

Authors

faeezeh haeerizadeh

دانشجوی کارشناسی ارشد، اصلاح نباتات، دانشگاه یاسوج، یاسوج

asad masoomi asl

نویسنده مسئول مکاتبات، استادیار، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج پست الکترونیک: Masoumiasl@yu.ac.ir

pezhman azadi

استادیار، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج

hamid rajabi-memari

استادیار، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران، اهواز

nafiseh aboofazeli

عضو شرکت دانش بنیان زیست فناوران نوین گیتی ژن، تهران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Asif, M.H., Dhauan, P. and Nath, P., ۲۰۰۰. A simple ...
  • Baker, J.T., Sanders, A.L., Maccotta, L. and Buckner, R.L., ۲۰۰۱. ...
  • Bell, D.A. and DeMarini, D., ۱۹۹۱. Excessive cycling converts PCR ...
  • Beutler, E., Gelbart, T. and Kuhl, W., ۱۹۹۰. Interference of ...
  • Brown, T.A., ۲۰۰۶. Gene cloning an introduction. Translated by: AhmadianTehrani, ...
  • Budavari, S., ۱۹۹۶. The Merck index- Encyclopedia of chemicals, Drugs ...
  • Cara, A., Gambino, G. and Schubert, A., ۲۰۰۷. A cetylmethylammonium ...
  • Chang, S., Puryear, J. and Carney, J., ۱۹۹۳. A simple ...
  • Claros, M.G. and Canovas, F.M., ۱۹۹۸. Rapid high quality RNA ...
  • Dean, W.L. and C. Tanford. ۱۹۷۸. Properties of a delipidated ...
  • Fu, X., Deng, S., Su, G., Zeng, Q. and Shi, ...
  • Gasic, K., Hernandez, A. and Korban, S., ۲۰۰۴. RNA extraction ...
  • Gelrig, H.H., Winter, K., Cusman, J., Borland, A. and Taybi, ...
  • Harsiah, C., Namasivayam, P. and Mohamed, R., ۲۰۱۲. Comparisons of ...
  • Hoppe, B.L., Conti-Tronconi, B.M. and Horton R.M., ۱۹۹۲. Gel-loading dyes ...
  • Kainz, P., ۲۰۰۰. The PCR plateau phase-towards an understanding of ...
  • Kamaloddini, H., Solooki, M., Riginegad, N. and Haddadi, F., ۲۰۰۶. ...
  • Kolosava, N., Miller, B., Ralph, S., Elis, B.E., Douglas, C., ...
  • Ky, H., Yeap, S.K. and Napis, S.B., ۲۰۱۲. The best ...
  • Le Provast, G., Herrera, R., Pavia, G., Chaumeil, P., Salin, ...
  • Lewinsohn, E., Steele, C.L. and Croteau, R., ۱۹۹۴. Simple isolation ...
  • Loomis, W.D., ۱۹۷۴. Overcoming problems of phenolics and quinones in ...
  • Lorenz, W.W., Yu, Y.S. and Dean, J.F.D., ۲۰۱۰. An improved ...
  • Mousazade Moghadam, M., Babavalian, H., Mirnejad, R. and Shakeri, F., ...
  • Paula, M.F.B., Sagio, S.A., Lazzari, F., Barreto, H.G., Pavia, L.V. ...
  • Powell, L.M., Wallis, S.C., Pease, R.G., Edwards, Y.H., Knott, T.J. ...
  • Reid, K.E., Olsson, N., Schlosser, J., Peng, F. and Lund, ...
  • Rodrigues, S.M., Soares, V.L., De Oliveira, T.M., Gesteira, A.S., Otoni, ...
  • Roux, K.H., ۲۰۰۹. Optimization and Trouble shooting in PCR. Cold ...
  • Rubio-Pina, J. and Zapata-Perez, O., ۲۰۱۱. Isolation of total RNA ...
  • Saiki, R.K., Scharf, S., Faloona, F., Mullis, K., Glenn, B., ...
  • Sambrook, J. and Russel, D.W., ۲۰۰۱. Molecular Cloning: A laboratory ...
  • Sarkar, G., Kapelner, S. and Sommer, S.S., ۱۹۹۰. Formamid can ...
  • Schneiderbauer, A., Sanderman H.Jr. and Ernst, D., ۱۹۹۱. Isolation of ...
  • Steele, C.L., Katoh, S., Bolmann, J. and Croteau, R.,۱۹۹۸. Regulation ...
  • Sullivan, D., Fahey, B. and Titus, D., ۲۰۰۶. Fast PCR: ...
  • Sun, Y., Hegamyer, G. and Colburn, N.H.,۱۹۹۳. PCR-directed sequencing of ...
  • Tattersall, E.A.R., Ergul, A., Alkayal, F., Deluc, L., Cushman, J.C. ...
  • Vasanthaiah, H.K.N., Katam, R. and Sheikh, M.B., ۲۰۰۸. Efficient protocol ...
  • Wang, T., Zhang, N. and Du, L., ۲۰۰۵. Isolation of ...
  • Warner, M.A. and Harper, J.V., ۱۹۸۵. Cardiac dysrhythmias associated with ...
  • Weyant, R.S., Edmonds, P. and Swaminathan, B., ۱۹۹۰. Effect of ...
  • Yang, G., Zhou, R., Tang, T. and Shi, S., ۲۰۰۸. ...
  • نمایش کامل مراجع