بررسی نظری و تجربی جهشهای جدید در پپتید هیستاتین ۳ به منظور افزایش خاصیت ضد میکروبی آن
Publish place: Nova Biologica Reperta، Vol: 11، Issue: 3
Publish Year: 1403
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 48
This Paper With 17 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_NBR-11-3_006
Index date: 31 December 2024
بررسی نظری و تجربی جهشهای جدید در پپتید هیستاتین ۳ به منظور افزایش خاصیت ضد میکروبی آن abstract
یکی از بحران های آینده نزدیک بشریت همه گیری بیماری های عفونی بعلت مقاومت آنتی بیوتیکی باکتری ها است. پپتیدهای خانواده هیستاتین دارای خصوصیت ضدمیکروبی علیه سویه های مقاوم به دارو و التیام زخم می باشند. در این پژوهش، ابتدا پپتید هیستاتین۳ توسط برنامه گرومکس ۵ به مدت ۵۰ نانوثانیه در حضور آب و یون ها و همچنین در حضور میسل SDS به عنوان مدل غشا باکتری شبیه سازی پویایی مولکولی شد. سپس به منظور افزایش خاصیت ضد باکتری، هشت جهش مختلف در این پپتید طراحی و ساختارآنها تهیه شد و هرکدام با همان شرایط قبل در حضور آب و در حضور آب و میسل SDS بطور جداگانه شبیه سازی پویایی مولکولی شدند و انرژی آزاد اتصال پپتیدها با میسل SDS با روش MM/PBSA محاسبه شد. در نهایت ۹۵۰ نانوثانیه شبیه سازی پویایی مولکولی در شرایط ذکر شده نشان داد که جهش ترکیبی D۱A-G۹W دارای منفی ترین انرژی آزاد اتصال به میسل SDS است. نتایج بررسی های آزمون های میکروبی MIC این جهش برروی باکتری های گرم مثبت و گرم منفی، نشان از افزایش خاصیت ضدمیکروبی آن برروی باکتری های گرم مثبت داشت.
بررسی نظری و تجربی جهشهای جدید در پپتید هیستاتین ۳ به منظور افزایش خاصیت ضد میکروبی آن Keywords:
Antimicrobial peptides , Molecular Dynamics simulation , MIC test , mutation , MM/PBSA binding energy , آزمون MIC , انرژی اتصال MM/PBSA , پپتیدهای ضدمیکروبی , جهش , شبیه سازی پویایی ملکولی
بررسی نظری و تجربی جهشهای جدید در پپتید هیستاتین ۳ به منظور افزایش خاصیت ضد میکروبی آن authors
Zahra Tavakoli
دانشگاه شهرکرد
Behnaz Saffar
دانشگاه شهرکرد
Karim Mahnam
دانشگاه شهرکرد
Rohollah Hemmati
دانشگاه شهرکرد
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
