سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

برآورد پارامترهای ژنتیکی صفت بازده خوراک با استفاده از مدل رگرسیون تصادفی در گاوهای شیری

Publish Year: 1403
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 28

This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download

Export:

Link to this Paper:

Document National Code:

JR_RAP-15-4_007

Index date: 18 March 2025

برآورد پارامترهای ژنتیکی صفت بازده خوراک با استفاده از مدل رگرسیون تصادفی در گاوهای شیری abstract

چکیده مبسوط مقدمه و هدف: با افزایش هزینه‎های خوراک و آشکارتر شدن اثرات زیست محیطی، افزایش جمعیت جهانی و تمرکز بیشتر بر پایداری، روش های بهبود بازده تبدیل خوراک گاوهای شیری به شیر، اهمیت فزاینده‎ای یافته است. گاو کارآمد گاوی است که به‎همان میزان که شیر و مواد جامد شیر تولید می‎کند، غذای کمتری مصرف کرده و سالم و بارور می‎ماند. بنابراین، امکان کاهش هزینه‎ها بدون کاهش تولید فراهم می‎شود. از طریق پیشرفت‎های فناوری، اندازه‎گیری دقیق صفات مربوط به بازده خوراک، مانند مصرف ماده خشک، وزن بدن، مصرف خوراک باقیمانده و ترکیبات شیر به‎راحتی در دسترس قرار گرفته است. لذا این پژوهش با هدف برآورد پارامترهای ژنتیکی صفت بازده خوراک و استراتژی های انتخاب بالقوه برای گنجاندن این صفت اقتصادی در برنامه‎های اصلاح نژادی، انجام گرفت. مواد و روش‎ها: در مطالعه حاضر از ۳۵۴۷۸ رکورد مصرف ماده خشک (DMI)، ۳۶۳۵۳ رکورد شیر اصلاح شده با انرژی (ECM)، ۲۷۸۹۶ رکورد وزن متابولیک بدن (MBW) و ۲۴۵۰۸ رکورد مصرف خوراک باقیمانده (RFI) از ۵۱۲۳ گاو هلشتاین اولین دوره شیردهی طی سال‎های ۲۰۰۸ تا ۲۰۱۸ مرکز اصلاح نژاد کشور استفاده شد. علاوه بر این، گاوهایی با اولین زایش بیش از ۴۰ ماه از تجزیه و تحلیل حذف شدند. فایل شجره شامل اطلاعات تا ۱۰ نسل برای گاوهای فنوتیپ شده بود که در نتیجه فایل شجره‎ای با ۹۴۷۱ حیوان ایجاد شد که از این تعداد ۹۷۸ و ۳۵۷۷ حیوان به‎ترتیب پدر و مادر بودند. داده‎های فنوتیپی ثبت شده از ۵ تا ۳۰۵ DIM برای ایجاد گروه‎های دوهفته‎ای شیردهی (Bi-WL) از تقسیم  DMIبه ۱۴ (در مجموع ۲۱ کلاس Bi-WL) استفاده شد. داده‎های اصلی در قالب رکوردهای روزانه (DMI و MBW)، هفتگی (ECM و MBW) و ماهانه (MBW) جمع‎آوری شدند. بنابراین، حیوانات باید حداقل دو رکورد برای DMI، ECM  و MBW در Bi-WL معین داشته باشند. وراثت‎پذیری، مولفه‎های واریانس و همبستگی‎های ژنتیکی بین هفته‎های شیردهی در طول دوره شیردهی با استفاده از مدل رگرسیون تصادفی محاسبه شد. به ‎منظور برآورد کوواریانس بین صفات از مدل حیوانی رگرسیون تصادفی دو صفتی استفاده شد. واریانس‎های باقیمانده همگن برای تجزیه و تحلیل دو صفتی در نظر گرفته شد، تا همگرایی نتایج را ممکن کند. هر دو مدل تک و دو صفتی با استفاده از الگوریتم AIREML توسط WOMBAT تجزیه و تحلیل شدند. همچنین ارزش‎های اصلاحی برای ضرایب رگرسیون تصادفی با استفاده از روش BLUP توسط BLUPF۹۰ اجرا شد. یافته‎ها: برآوردهای وراثت‎پذیری از ۰/۱۷ تا ۰/۴۱ برای مصرف ماده خشک، ۰/۲۸ تا ۰/۴۵ برای شیر تصحیح شده با انرژی، ۰/۴۸ تا ۰/۷۸ برای وزن متابولیک بدن و ۰/۱ تا ۰/۲ برای مصرف خوراک باقیمانده متغیر بود. برآوردهای وراثت‎پذیری برای RFI متوسط بود، از ۰/۲ در اولین کلاس Bi-WL تا ۰/۱۳ در آخرین کلاس Bi-WL با حداقل وراثت‎پذیری در کلاس‎های ۱۴ و ۱۵ Bi-WL (۰/۱). تغییرات بین مراحل مختلف شیردهی برای RFI نیز مشاهده شد. همبستگی‎های ژنتیکی برای RFI از ۰/۲۶ تا ۰/۹۹ متغیر بود. کمترین همبستگی بین اواسط شیردهی (کلاس ۵ تا ۱۱Bi-WL ؛ تقریبا ۷۰ تا ۱۵۴ DIM) و اواخر شیردهی (کلاس ۱۲ تا ۲۱Bi-WL ؛ تقریبا ۱۶۸ تا ۳۰۵ DIM) مشاهده شد. همبستگی های ژنتیکی درون صفتی بین هفته های شیردهی که نزدیک به‎هم بودند، برای تمام صفات مورد مطالعه قوی‎تر بود. همبستگی ژنتیکی بین RFI و MBW از ۰/۶۴ در اوایل شیردهی تا ۰/۴۵- در اواخر شیردهی متغیر بود. آنالیز نسبت گاوهای نر مشترک برای ۱۰ درصد بالا در طول شیردهی نشان داد که گاوهای نری که بالاترین رتبه را برای RFI در اواسط شیردهی دارند، احتمالا در بین گاوهای نر برتر در سایر مقاطع شیردهی باقی بمانند. همچنین دوره بعد از اوج شیردهی یعنی روزهای ۱۴۰ تا ۲۲۶ شیردهی(کلاس ۱۰ تا ۱۹ Bi-WL) می‎تواند چارچوب خوبی برای انتخاب صفات بازده خوراک باشد. نتیجه‎گیری: برای ارزیابی تاثیرات DMI، ECM  و MBW هنگام انتخاب برای RFI، میانگین EBV برای همه صفات، بر اساس ۱۰ درصد گاوهای نر برتر برای RFI استفاده شد. مقادیرEBV ها از ۱۰ درصد گاوهای نر برتر برای RFI دارای ۲/۷۹ انحراف استاندارد کمتر از میانگین جمعیت بود، که نشان می‎دهد در صورت انتخاب این حیوانات، کاهش RFI  (افزایش کارایی) در جمعیت انتظار می‎رود. انتخاب بر اساس RFI به‎نفع حیوانات با مقادیر RFI پایین‎تر است. مقادیر منفی RFI نشان می‎دهد که حیوان بر اساس تولید و سایر عوامل تعدیل، خوراک کمتری از حد انتظار مصرف می‎کند. همبستگی‎های ژنتیکی برآورد شده بین صفات در طول زمان نشان می‎دهد که مکانیسم‎های متابولیکی بالقوه متفاوتی بین مراحل شیردهی فعال هستند. با توجه به تغییرات این همبستگی‎ها در طول دوره شیردهی، مهم است که مراحل مختلف شیردهی را به‎طور جداگانه در نظر بگیریم و در یک برنامه انتخابی همه صفات را به‎طور همزمان وارد مدل نمائیم. درک رابطه بین DMI، MBW، ECM، RFI و صفاتی مانند تعادل انرژی و امتیاز وضعیت بدن برای یک رویکرد یکپارچه و موفق، جهت اصلاح نژاد صفت FE مهم است. همچنین حیوانات با پتانسیل ژنتیکی بالا برای تولید، تمایل به مصرف غذای بیشتری برای برآوردن نیازهای تولیدی بالای خود دارند. هدف از توجه به ناکارآمدی استفاده از خوراک، یک روش بالقوه برای بهبود کارایی مزرعه و در عین حال کاهش هزینه های تولیدکننده است.

برآورد پارامترهای ژنتیکی صفت بازده خوراک با استفاده از مدل رگرسیون تصادفی در گاوهای شیری Keywords:

برآورد پارامترهای ژنتیکی صفت بازده خوراک با استفاده از مدل رگرسیون تصادفی در گاوهای شیری authors

فاطمه علاء نوشهر

Department of Animal Sciences, Faculty of Agriculture and Natural Resources, University of Mohaghegh Ardabili, Ardabi, Iran

رضا سید شریفی

Department of Animal Sciences, Faculty of Agriculture and Natural Resources, University of Mohaghegh Ardabili, Ardabi, Iran

جمال سیف دواتی

Department of Animal Sciences, Faculty of Agriculture and Natural Resources, University of Mohaghegh Ardabili, Ardabil, Iran

نعمت هدایت ایوریق

Department of Animal Sciences, Faculty of Agriculture and Natural Resources, University of Mohaghegh Ardabili, Ardabil, Iran

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Alijani, S. (۲۰۱۵). Comparison of Two Singles-and Multiple Trait Random ...
Berry, D. P., & Crowley, J. J. (۲۰۱۳). Cell biology ...
Brito, L. F., Oliveira, H. R., Houlahan, K., Fonseca, P. ...
Connor, E. E. (۲۰۱۵). Invited review: Improving feed efficiency in ...
Connor, E. E., Hutchison, J. L., Norman, H. D., Olson, ...
Houlahan, K., Schenkel, F. S., Hailemariam, D., Lassen, J., Kargo, ...
Hüttmann, H., Stamer, E., Junge, W., Thaller, G., & Kalm, ...
Jamrozik, J., & Schaeffer, L. R. (۱۹۹۷). Estimates of genetic ...
Kirkpatrick, M., Lofsvold, D., & Bulmer, M. (۱۹۹۰). Analysis of ...
Koch, R. M., Swiger, L. A., Chambers, D., & Gregory, ...
Krattenmacher, N., Thaller, G., & Tetens, J. (۲۰۱۹). Analysis of ...
Li, B., Berglund, B., Fikse, W. F., Lassen, J., Lidauer, ...
Li, B., Fikse, W. F., Lassen, J., Lidauer, M. H., ...
Li, B., Fikse, W. F., Løvendahl, P., Lassen, J., Lidauer, ...
Liinamo, A. E., Mäntysaari, P., Lidauer, M. H., & Mäntysaari, ...
Liinamo, A. E., Mäntysaari, P., & Mäntysaari, E. A. (۲۰۱۲). ...
Lu, Y., Vandehaar, M. J., Spurlock, D. M., Weigel, K. ...
Manzanilla-Pech, C. I. V., Veerkamp, R. F., Calus, M. P. ...
Manzanilla-Pech, C. I. V., Veerkamp, R. F., Tempelman, R. J., ...
Meyer, K. (۲۰۰۷). WOMBAT—A tool for mixed model analyses in ...
Mohammadi, A., Alijani, S., Rafat, S. A., Taghizadeh, A., & ...
Oliveira, H. R., Brito, L. F., Lourenco, D. A. L., ...
Seymour, D. J., Cánovas, A., Chud, T. C. S., Cant, ...
Shadpour, S., Chud, T. C., Hailemariam, D., Oliveira, H. R., ...
Sjaunja, L. O. (۱۹۹۰). A Nordic proposal for an energy-corrected ...
Tempelman, R. J., Spurlock, D. M., Coffey, M., Veerkamp, R. ...
VanRaden, P. M. (۲۰۰۸). Efficient methods to compute genomic predictions. ...
نمایش کامل مراجع