بررسی میزان کارآیی روش Real-time PCR با استفاده از دو راهکار رسم منحنی استاندارد و رگرسیون خطی
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 3,444
This Paper With 11 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS12_0452
تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392
Abstract:
زمینه و هدف: آنالیز کمی mRNA با استفاده از Real-Time PCR به وسیله روش سایبرگرین به طور وسیعی در مطالعات بیولوژیک کاربرد بسیاری پیدا کرده است. هدف این تحقیق مقایسه کارایی PCR محاسبه شده با استفاده از دو روش شیب خط نمودار استاندارد و نرم افزار LinRegPCR جهت تعیین استراتژی بهتر برای محاسبات کاراییی PCR می باشد. روش بررسی: در این پژوهش پس از خونگیری و استخراج RNA و سنتز cDNA فرآیند qRT-PCR انجام شد. سپس محاسبات PCR Efficiency به دو روش رسم منحنی استاندارد و همچنین با استفاده از نرم افزار LinReg PCR انجام گرفت و در ن هایت این دو روش آنالیز با هم مقایسه شدند. یافته ها: میزان کارآیی PCR محاسبه شده برای سه ژن TGF β, GAPDH و IL-10 با روش منحنی استاندارد به ترتیب 1/99، 1/81 و 1/87 و همچنین با روش استفاده از نرم افزار رایانه ای LinReg PCR کارآیی این سه ژن به ترتیب 1/98، 1/82 و 1/82 به دست آمد. نتیجه گیری: نتایج این تحقیق نشان می دهد که در آنالیز داده های حاصل از تکثیر cDNA میزان کارایی PCR به دست آمده برای سه ژن TGF β, GAPDH و IL-10 با دو روش مختلف منحنی استاندارد و LineRegPCR نتایج تقریباً یکسانی حاصل می شود. بنابراین، توصیه می شود که به جای روش پرهزینه منحنی استاندارد از نرم افزرا LineRegPCR استفاده گردد.
Keywords:
, PCR Efficiency , Real-Time PCR , نمودار استاندارد (standard curve) , نرم افزار LinReg PCR , qRT-PCR , SYBR® Green
Authors
جواد محمدی اصل
گروه ژنتیک پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز، ایران
علی خدادادی
گروه ایمونولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپوراهواز، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :