مطالعه الگوی کدون های کاربردی و تعیین کدون های بهینه در ژنوم کلروپلاست برنج (Oryza sativa)

Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 846

This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS12_0676

تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392

Abstract:

به منظور بهینه سازی تولید پروتئین در سیستم های بیانی، تحلیل الگوی کدون های مترادف و تعیین کدون های بهینه بسیار مهم است. در این راستا کلروپلاست، به علت اندازه ژنوم کوچک و تعداد کپی برداری زیاد از اهمیت ویژه ای برخوردار است. از این رو پژوهش حاضر به تحلیل الگوی کدون های مترادف و تعیین کدون های بهینه در کلروپلاست گیاه برنج با استفاده از روش های چند متغیره آماری پرداخته است. نتایج حاصل از NC-plot نشان داد که اگر چه اکثر نقاط زیر منحنی مورد انتظار قرار گرفتند، ولی تعداد کمی از ژن ها بر روی منحنی واقع شدند. همچنین همبستگی معنی داری بین شاخص CAI و محور اول در آنالیز تطبیقی (r=0/612**) وجود داشت که نشان دهنده انحراف کدونی بیشتر در ژن های با سطح بیان بالاتر بود. در این تحقیق کدون های بهینه برای ژنوم کلروپلاست برنج نیز معرفی شد که این امر می تواند برای معرفی جهش های نقطه ای و تغییر ژن ها به منظور افزایش تولید پروتئین در مهندسی ژنتیک کلروپلاست، مفید و مؤثر باشد.

Authors

رسول محمدی نجف آبادی

دانشجوی دکترای اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Duret, L, D. Mouchiroud, 1999. Expression pattern and, surprisingly, gene ...
  • G hae mmaghami, S., W.K. Huh, K. Bower, R.W. Howson, ...
  • Gouy, MI., C. Gautier, 1982. Codon usage in bacteria: correlation ...
  • Ikemura, T., 1985. Codon usage and tRNA content in unicellular ...
  • Kanaya, S., Y. Yamada, M. Kinouchi, Y. Kudo, T. Ikemura, ...
  • Kanaya, S., Y. Yamada, Y. Kudo, T. Ikemura, 1999. Studies ...
  • Ko, H.J., S.Y. Ko, Y.J. Kim, E.G. Lee, S.N. Cho, ...
  • _ _ _ enhance expression of an _ in transgenic ...
  • Rouwendal, G.J.A., O. Mendes, E...H. Wolbert, A. Douwe de Boer, ...
  • Wright, F., 1990. The :effective number of codons" used in ...
  • نمایش کامل مراجع