شناسایی miRNA های درگیر در پاسخ تنش خشکی برنج با استفاده از توالی‌یابی با کارایی بالا

Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 893

This Paper With 15 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

CAST01_106

تاریخ نمایه سازی: 7 تیر 1393

Abstract:

MiRNA مولکول‌هآی کوچک غیر کدکننده هستند که بیان ژن‌ها را از طریق ایجاد برش در miRNA یا ممانعت از ترجمه تنظیم می‌کنند. این مولکول‌ها در بسیاری از فرآیندهای مختلف بیولوژیکی و متابولیکی گیاه نقش داشته و با تنظیم حساس و دقیق ژن‌ها، امکان پاسخ مناسب گیاه به تغییرات مراحل رشدی یا شرایط محیطی را فراهم می‌کنند. در این مطالعه از توالی یابی با کارایی بالا به منظور شناسایی miRNA های درگیر در پاسخ گیاه برنج به تنش خشکی استفاده شد. از میان 708 miRNA شناخته شده برنج 88 miRNA تغییر بیان معنی‌داری را نشان دادند. بسیاری از miRNA هایی که تغییر بیان نشان دادند بودند، در تنظیم بیان ژن‌های کدکننده فاکتورهای رونویسی و پاسخ به تنش نقش دارند. مهمترین مسیرهایی که این miRNA ها در کنترل آن‌ها نقش داشتند، مسیر پیام‌رسانی اکسین، مسیر پیام‌رسانی اسیدابسزیک و مسیر کنترل گلدهی گیاه بودند. نقش هورمون‌های گیاهی در پاسخ به تنش اثبات شده و تنظیم بیان این هورمون‌ها در سطح پس از رونوشت‌برداری ژن‌های کدکننده آن‌ها نشان دهنده راهکار گیاه برنج با بکارگیری miRNA در پاسخ به تنش خشکی می‌باشد. در این مطالعه هم‌چنین چندین miRNA جدید در برنج شناسایی شد. این نتایج درک بهتری از نقش miRNA در پاسخ گیاه در مواجه با تنش ارائه داده و نشان داد که miRNAها نقش مهمی را به عنوان فاکتور کلیدی در کنترل پاسخ برنج به تنش خشکی ایفا می‌کنند.

Keywords:

برنج , تنش خشکی , توالی‌یابی با کارایی بالا , miRNA

Authors

احسان محسنی فرد

دانشجوی دکتری گروه بیوتکنولوژی و بهنژادی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

محمد فارسی

استاد گروه بیوتکنولوژی و بهنژادی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

امین میرشمسی کاخکی

استادیار گروه بیوتکنولوژی و بهنژادی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

بهنام بخشی

دانشجوی دکتری گروه اصلاح نباتات، واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Ambros, V., B. Bartel, et al. (2003). "A uniform system ...
  • Archak, S. and J. Nagaraju (2007). "Computational Prediction of Rice ...
  • Barrera-F igueroa, B. E., L. Gao, et al. (2012). "High ...
  • Bartel, D. P. (2005). "MicroRNAs: genomics, biogenesis, mechanism, and function." ...
  • Covarrubias, A. _ and J. L. Reyes (2010). "Po st- ...
  • Curaba, J., M. Talbot, et al. (2013). "O ver-expression of ...
  • Dubos, C., R. Stracke, et al. (2010). "MYB ranscription factors ...
  • Flynt, A. S. and E. C. Lai (2008). "Biological principles ...
  • Ganjeali, A., H. Porsa, et al. (2011" .(Assessment of Iranian ...
  • Hai, L. A., J. A. Shenghua, et al. (2012). "Four ...
  • Jain, M., A. Nijhawan, et al. (2006). "Validation of housekeeping ...
  • Kantar, M., S. J. Lucas , et al. (2011). "miRNA ...
  • Khraiwesh, B., J.-K. Zhu, et al. (2012). "Role of miRNAs ...
  • Kong, Y. M., A. A. Elling, et al. (2010). "Differential ...
  • Kramer, P. P. J. and J. S. Boyer (1995). Water ...
  • Kulcheski, F. R., L. F. de Oliveira, et al. (2011). ...
  • Lee, Y., M. Kim, et al. (2004). "MicroRNA genes are ...
  • Li, H., Y. Dong, et al. (201 1). _ 'C ...
  • Li, T., H. Li, et al. (2011" .(Identification and analysis ...
  • Li, W.-X., Y. Oono, et al. (2008). "The Arabidopsis NFY ...
  • Lu, W., J. Li, et al. (2011). "Expression pattern of ...
  • Meyers, B. C., M. J. Axtell, et al. (2008). "Criteria ...
  • Phillips, .J. R., T. Dalmay, et al. (2007). "The role ...
  • Ren, Y., L. Chen, et al. (2012). "Identification of novel ...
  • Ribaut, J, M. Banziger, et al. (2002). "Use of molecular ...
  • Shinozaki, K. and K. Y amaguchi- Shinozaki (2007). "Gene networks ...
  • Soderman, E., M. Hjellstrom, et al. (1999). "The HD-Zip gene ...
  • Sunkar, R., V. Chinmusamy, et al. (2007). "Small RNAs as ...
  • Sunkar, R., X. Zhou, et al. (2008). "Identification of novel ...
  • Trindade, I., C. Capitao, et al. (2010). "miR398 and miR408 ...
  • Varkonyi- Gasic, E., R. Wu, et al. (2007). "Protocol: a ...
  • Vaucheret, H. (2008). "Plant Argonautes." Trends Plant Sci. 13(7): 350-358. ...
  • Voinnet, O. (2009). "Origin, biogenesis, and activity of plant microRNAs." ...
  • Wang, C., J. Han, et al. (2012). "Identification of microRNAs ...
  • Xin, M., Y. Wang, et al. (2010). "Diverse set of ...
  • Xue, L.-J., J.-J. Zhang, et al. (2009). _ 'C haracterization ...
  • Yoshida, S., D. A. Forno, et al. (1971). Laboratory manual ...
  • Zhou, L , .Y. Liu, et al. (2010). "Genome-wide identification ...
  • Zhu, Q.-H., A. Spriggs, et al. (2008). "A diverse set ...
  • نمایش کامل مراجع