بررسی بیوانفورماتیکی لینالول سنتاز در خانواده های نعناعیان و چندین خانواده های گیاهی دیگر

ترپن ها یکی از مهم ترین گروه های تشکیل دهنده متابولیت های ثانویه گیاهی می باشند که دارای کاربردهای فراوانی در صنعت و پزشکی می باشند. یکی از مهم ترین گروه ترپن ها، مونوترپن ها می باشند. لینالول از جمله مونوترپن هایی است که علاوه بر مصرف زیاد در صنایع آرایشی – بهداشتی در درمان بیماری های مانند سرطان سینه و نیز درمان لوسمی مورد استفاده قرار می گیرد. این ماده در گیاهان توسط لینالول سنتاز از پیش ساز عمومی مونوترپن ها یعنی ژرانیل دی فسفات تولید می شود. با توجه به اهمیت بالای این دست از متابولیت های ثانویه گیاهی، بررسی و شناخت بیشتر این متابولیت ها حائز اهمیت می باشد. ژن کدکننده ی این آنزیم در گونه های مختلف گیاهی از جمله در خانواده های نعناعیاندر دو جنس منتاو پریلاتوالی یابی شده است. هدف از این تحقیق مطالعه بیوانفورماتیکی توالی های پروتئینی مربوط به ژن مزبور می باشد. ابتدا توالی های پروتیینیلینالول سنتاز مربوط به چندین خانواده ی گیاهی از پایگاه اطلاعاتی NCBIدریافت شد. سپس با استفاده از نرم افزار ClustalWهم ردیفی توالی ها صورت گرفت و درخت فیلوژن این پروتئین ها رسم شد . تعداد اسید آمینه های پروتیینلینالول سنتاز در بین گیاهان بررسی شده در این تحقیق بین 569-871 بود. بیشترین وزن مولکولی مربوط به گونه Clarkia concinnaبا 99/587 کیلودالتو نمی باشد و نقطه ایزوالکتریک آن ها در محدوده 5-7 است و بیشترین شاخص آلیفاتیک که به عنوان یک عامل مثبت برای آزمایش مقاومت حرارتی می باشد مربوط به Solanumlycopersicum است.

Keywords:

بیوانفورماتیک , ترپنوییدها , لینالول سنتاز , مونوترپن ها , نعناعیان