مقایسه فیلوژنی توالی برخی جدایههای ویروس برونشیت عفونی پرندگان ایران

برونشیت عفونی پرندگان بیماری حاد، بسیار مسری با انتشار جهانی میباشد که علیرغم واکسیناسیون علیه آن گزارشاتی از شیوع و ظهورویروس مشاهده میشود. جهشهای نقطهای و نوترکیبی ژنوم ویروس موجب تکامل مداوم آن شده، بنابراین ظهور واریانتهای ویروس برونشیت عفونی پرندگان کنترل این بیماری را پیچیده نموده است. در این مطالعه توالی زیرواحد ژنS از 18 سویه رفرنس با 25 جدایه ایرانی بهدست آمده از بانک ژن مورد بررسی قرار گرفت. توالیهای مورد بررسی با نرمافزارBioEditهمردیف 1 شدند. با ترسیم درخت فیلوژنی این 43 سویه به پنج گروه اصلیI, II, III, IV, Vتقسیم شد. سویههای گروه کشنده Iشامل جدایه های ایرانی ,IR/8/2011و،(IRFIBV (13b, 4, 13, 6, 9, 20, 7, 31), IR-Razi-HKM3-2010,جدایه ترکیهای ،(chicken/Turkey/10RS- 3161 /2010 جدایه عراقی Sul/01/09)و جدایههایSH1, A2, Tاست. استرینهای گروه بیماریزای خفیفII شامل جدایه های ایرانی IR/43/08, IR/11/2011 وH120 (IR), IR/70/02و جدایههایTAE340552وConn, H120, H52, Ma5, M41,میباشد. استرینهای گروه بیماریزای شدید III شامل جدایه ایرانیPCRLab/06/2012 و جدایه هایSDLY0612, QXIBV, A2-2 و گروه بیماریزای بسیار شدیدIV شامل جدایه Qu16, Grayو گروه بیماریزای متوسط V شامل جدایههای ایرانیIR/573/98, IR-1062-GA, IR-3654-VM, IR-1061-PH, ،(IR/525/99, IR/14/07, IR/14/2011, IR-Razi-HKM4-2010, IR/19/08, 4/91 (IR) جدایههایCR8812، 4/91 میباشد. تشابه بین جدایههای مختلف ایرانی بین 99/96-72/7% بود که حداقل آن بین جدایههای گروهII باگروه V بود واکسنهای این بیماری که همگی وارداتی میباشند، تشابه ژنتیکی آنها با سویههای ایرانی مطابقت کامل ندارد و کارایی لازم را ندارند لذا تولید واکسن از سویههای ایرانی برای افزایش کارایی پیشنهاد میگردد

Keywords:

ویروس برونشیت عفونی طیور , ژن اسپایک , درخت فیلوژنی , توالی نوکلئوتیدی