مقایسه هاپلوتایپی برخی ژنوتیپهای سیب ترش ایران با پنج رقم و پایه متداول

روش تفاوت قطعات تکثیر شده شکسته برای بررسی روابط هاپلوتایپی برخی ژنوتیپهای سیب ترش مزه ایران بکار برده شده و نتایج بابرخی ارقام و پایههای بینالمللی مقایسه شده است. از مزایای این روش تحلیل راحت، صرفه جویی در زمان و هزینه، تکرار پذیر بودن آن میباشد. تقریباbp6990 از ژنوم کلروپلاست با کاربرد پنج جفت آغازگر عمومی کلروپلاستSfM و CS ،HK ،K1K2 ،B1B2 آنزیم برشی محدودگرEcoRIبررسی گردید. نتایج نشان دادند که آغازگرهایSfMبه علت تعدد باندهای تولیدی وcsبه علت عدم داشتن جایگاه برش در این بررسی قابل بهره برداری نبوند اما قطعات تکثیری توسط سایر آغازگرهاحالت چند شکلی نشان دادند. تمام جهشهایشناسایی شده حذف - اضافه در محدوده40bp-10- بودند. ترکیب تمام جهشها هشت هاپلوتایپ را در نمونههای مورد بررسی معرفی نمود. اکثر نمونههای ترش و دو رقم گرانی اسمیت و فوجی که مزه ترشتری دارند در یک هاپلوتایپH8قرار گرفتند که این نکته می تواند نشانهای از وجود یک جد مادری مشترک در ژنوتیپهای ترش باشد اما بطور طعنه داری ژنوتیپ ترش مصری در هاپلوتایپH2 قرار گرفت. مطالعه تفاوتهاDNAکلروپلاستی به دلیل شکستن جامعههای بزرگ به جمعیتهای کوچکتر میتواند شرایط را برای بررسی نمونههای کمتر توسط نشانگرهای دقیقتر در حجم کاری کمتر محیا نماید. در این ارتباط روشCAPبرای مشخص نمودن هاپلوتایپها یک روش بسیار مناسب میباشد

Keywords:

سیب , هاپلوتایپ , ژنوم کلروپلاست , آغازگر عمومی کلروپلاست , آنزیم برشی