بررسی تغییرات در الگوی بیان ژن در طی تنشهای شوری و اکسیداتیوبا استفاده از تجزیه و تحلیل داده های میکرواری در آرابیدوپسیس

تنشهای غیر زنده رشد و توسعه گیاهان را تحت تاثیر قرار میدهند. واکنشهای گیاه در برابر آنها با تغییرات زیادی در شبکههای پیچیده ژن همراه است. در پژوهش حاضر تغییرات در الگوی بیان ژنها در شرایط تنش شوری و اکسیداتیو و ارتباط بین آنها در گیاه آرابیدوپسیس مورد بررسی قرار گرفت. دادههای خام شرایط کنترل و تنش از پایگاه دادهTAIR گرفته شد .جهت تعیین تفاوت معنیداری بیان ژنها بین شرایط کنترل و تنش از روش t-test استفاده شد. نتایج نشان داد که به ترتیب بیان 1721 و 1084 ژن پس از تنش شوری و اکسیداتیو در برگ افزایش یافته است. همچنین بیان 83 ژن در هر دو تنش کارکردی ژنهایی که در هر دو تنش افزایش بیان داشتهاند نشان داد که نزدیک به 38 درصد از آنها در گروه های RNA پروتئین، پیام رسانی وDNAدخالت دارند. شوری و اکسیداتیو افزایش یافت که نشان دهنده ارتباط قوی بین پاسخهای تنش شوری و اکسیداتیو میباشد . آنالیز ترکیب

Keywords:

تنش , میکرواری , آرابیدوپسیس , بیوانفورماتیک