شناسایی نواحی ریز ماهواره در ترادف های EST گیاه پوکسیلنیا تنیفلورا و کاربرد آن بعنوان نشانگر مولکولی

Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 624

This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI08_0627

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

Abstract:

دراین مطالعه، ترادف های حاوی توالی های تکراری ساده(SSR) از مجموعه رکوردهای EST ثبت شده در ژن بانک در گیاه پوکسینلیا تنیفلورا (Puccinellia tenuiflora)، شناسایی واستخراج شد. سپس از مناطق مجاور ناحیه تکراری 177 جفت آغازگر رفت و برگشتی مناسب برای کاربرد بعنوان نشانگرمولکولی طراحی گردید. نتایج نشان داد که از مجموع 3815 ترادف EST مورد بررسی ، 243 رکورد واجد نواحی ریز ماهواره هستند بطوریکه موتیف های چهار نوکلئوتیدی با 63 درصد فراوانی بیشترین میزان وقوع در بانک EST گیاه، را داشتند. گیاه پوکسیلنیا تنیفلورا یک گونه شورزیست با خصوصیات علوفه ای ارزشمنداز تیره گرامینه می باشد که مقاومت بالایی به تنش های شوری و غرقابی دارد. بعنوان یک راهکارهالوفیتی، توسعه کشت این گیاه در مناطق شور و استفاده از آب های هرز به منظور تامین علوفه و حفظ محیط زیست حائز اهمیت است. آغازگرهای طراحی شده در این تحقیق می توانند در مطالعات تنوع ژنتیکی توده های بومی، سلکسیون وبهبود صفات استفاده شوندو درپروسه زراعی کردن این گیاه موثر باشند.

Keywords:

داده کاوی , ترادف بیان شونده ی نشاندار , پوکسینلیا تنیفلورا , نشانگر EST-SSR

Authors

مریم میدانسری

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

احسان شکری

کارشناس ارشد اصلاح نباتات؛ عضو هیئت علمی پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان

قربانعلی نعمت زاده

استاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Chagne D, Chaumeil P, Ramboer A, Collada C, Guevara A, ...
  • Chambers, G. K and E. S. Mac Avoy., (2000). Microsatellite ...
  • Gutierrez MV, Patto MCV, Huguet T, Cubero JI, Moreno MT, ...
  • Li ewlaks aneeyanawin C, Ritland CE, El-Kassaby YA, Ritland K., ...
  • Pashley CH, Ellis JR, McCauley DE, Burke JI., (2006). EST ...
  • Palmieri, D. A., v. M. Novelli, M. Bastianel., M. Cristofani ...
  • Wang, C., G. Wangzhen., C. Caiping and Z. Tianzhen. (2001). ...
  • نمایش کامل مراجع